全基因组复制是极其强大的演化力量，而人们非常关注的是，这些事件中复制的基因发生了什么。现在，纤毛虫Paramecium  tetraurelia的基因组序列已经测序完成，它的近4万个基因（它是一个基因非常丰富的基因组）表明，至少有三个连续的全基因组复制。由于基因顺序在Paramecium中保持得特别好，所以有可能对在每个事件中所复制的基因进行识别，从而为在复制之后不同时间的基因损失情况提供一个完整的画面。