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454测序技术出产Nature、Science文章

更新:2006-11-20 来源:生物通 作者:佚名 【
        CuraGen  Corporation公司(NASDAQ:  CRGN)旗下拥有其多数股权的子公司454  Life  Sciences公司11月15日宣布,他们利用454  SequencingTM将穴居人DNA序列与人类、黑猩猩的基因组序列进行比对,发现现代人类和穴居人祖先在距今大约50万年以前分道扬镳,并且他们共同祖先的population的有效大小(effective  size)与现代人类的population的有效大小相差无几。研究结果刊登于Nature杂志,文章题目为《Analysis  of  one  million  base  pairs  of  Neandertal  DNA》。

        马克斯-普朗克协会进化人类学研究所(Max  Planck  Institute  for  Evolutionary  Anthropology)所长Svante  Pääbo说:直接对穴居人化石样本中提取的DNA进行高通量454测序,测序结果成为穴居人基因组(包括与人类核DNA序列相似的一百万对碱基)研究的一项重要组成部分,我们对穴居人全基因组进行测序的信心更加坚定了。对穴居人基因组进行测序,为鉴别现代人(解剖学定义)基因组特异遗传变化提供了独到的帮助。

        关于相同穴居人化石样本的一篇平行报道也刊登于本周Science网络版。Pääbo在Science文章说:“实验过程包括传统的建库(library  preparation,生物通编者译)步骤,90%以上的碱基对都经过454测序。”

        “能在Nature和Science上发表文章,是对454测序技术的进一步肯定,说明我们逐步成为广泛、快速、准确测序任何基因组,甚至已经发生高度降解的样本的基因组的金标准,”454    Life  Sciences公司CEO  Christopher  McLeod说,“我们相信与测序任何个体人类基因组相比,穴居人基因组研究结果能够为人类生物学带来更多的发现。”

        由于细菌DNA对化石样本的污染,测序穴居人基因组与测序人类基因组相比,需要做的工作更多。454  Life  Sciences公司研制的Genome  Sequencer  20  系统克服了这一障碍,一台  Genome  Sequencer  20能够在五小时内,对小量骨化石中的约25万单一DNA序列进行测序。所确定的DNA序列长度为100-200bp,古DNA片段(ancient  DNA  fragments)长度恰好吻合。

        穴居人测序小组今后两年中打算绘制30亿个碱基对组成的穴居人基因组草图,中期目标是完成穴居人线粒体基因组测序,以对“穴居人母体DNA对现代人类DNA有无捐献”这个问题做出回答。

        基因组测序仪Genome  Sequencer  20TM  system  (GS  20)  由罗氏应用科学454  Life  Sciences公司独家代理。详情请登陆:http://www.roche-applied-science.com  .(生物通记者  小粥)
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