黑龙江省农业良种化工程自实施以来，已累计投资2.14亿元，经过11年的发展，取得了显著成效。该工程使全省主要农作物品种更换周期由过去的7~8年缩短至3~5年，全省良种覆盖率稳定在98%以上，良种科技贡献率达到40%，比上年提高1个百分点。种子供应和安全保障能力也得到了显著提升。

农业的发展离不开优质的种子，良种化工程正是抓住了这一关键，通过品种创新促进农业增产和农民增收。截至2011年，全省共招标选育了254个优质及专用品种，其中大多数品质指标已与国际标准接轨，部分品种甚至达到或超过了世界先进水平。

在品种选育方面，黑龙江省形成了以省农科院、东北农业大学农垦科学院等科研院校为主导，以种子营销企业、民营科研单位为辅助的多元化科研育种体系。全省已有137家单位具备新品种选育能力，共引进省外品种218个，从国外引进优良新品种219份，累计引进育种材料1200多份。

为了保障种子供应，黑龙江省通过良种化工程巩固完善了生产繁育基地，年可生产原种1500万公斤、良种6亿公斤。全省商品种子供应率由20世纪90年代中期的30%提高到目前的75%，其中杂交作物供种率达到100%，水稻供种率为80%，大豆供种率为48%，小麦供种率为73%。

此外，良种化工程还推动了种子产业化的发展，一批有实力的骨干种子企业正在崛起。截至目前，全省有种子企业671家，其中包括黑龙江北大荒集团有限公司、齐齐哈尔市富尔农艺有限公司等全国种业骨干企业。

专家认为，农业良种化工程对黑龙江省种业发展起到了明显的推动作用，提高了粮食产量和农产品竞争力。然而，面对现代化大农业的要求，仍需在基础材料创造、育种方法研究和新技术应用等方面继续努力。