生物发酵产业作为生物制造的核心领域，占据了生物制造产业的80%以上份额。然而，随着行业的发展，传统发酵产品的成本不断上升，利润却逐渐下降，行业转型迫在眉睫。中国生物发酵产业协会理事长石维忱指出，延长产业链、生产高附加值产品是我国生物发酵工业转型的关键。

生物发酵产品已广泛应用于纺织、造纸等多个行业。2011年，我国生物发酵产业产品产量达到2055万吨，产值为2500亿元，而2005年这两项数据分别为800万吨和400亿元。产品种类也从三大类50多种发展到七大类300多种。然而，与生物医药、生物农业等重点产业相比，发酵工业仍显低调。

石维忱强调，延长产业链需要在应用研究、内需拉动、新菌株筛选等方面实现突破。例如，柠檬酸80%依赖出口，但国内洗涤剂行业对柠檬酸的应用研究不足，导致内需市场开发受限。此外，酶制剂在纺织行业的应用可以缩短工艺流程，节省水资源，但国内酶制剂市场主要被国际巨头占据。

在基础研究方面，新菌株的筛选至关重要。石维忱指出，我国在原始菌种的研究和筛选上不足，多数依赖既有菌种的改造，这限制了知识产权的掌握。诺维信的经验表明，建立品种丰富的菌株库，并以市场为导向，可以高效转化研发成果。

石维忱建议，产业链的延长应聚焦于生物基材料的生产，如将乳酸加工成聚乳酸，应用于纺织、医药、农业等领域。此外，利用酶制剂替代传统粮食原料，发展非粮生物醇、生物制氢等新一代生物燃料生产技术，也是产业链延长的重点。

功能性配料和发酵制品也是产业链延长的重要方向。例如，食品和保健品中需要的益生元、益生菌等有益因子和功能因子，恰恰来自发酵工业，这也是行业值得关注的增长点。