转基因水稻在中国一直处于争议的漩涡中。尽管中国农业部从未批准任何转基因主食的商业化种植，但欧盟的预警通报显示，2012年共有28批次来自中国（包括香港）的违禁转基因食品被通报，其中24批次是大米制品。这表明，转基因水稻可能已悄然流入市场。

南方周末记者深入福建、浙江等地的试验基地，调查了70多家种业公司和种站，试图还原转基因水稻扩散的真相。调查发现，尽管政府严打，但转基因水稻的扩散似乎难以完全遏制。

在福建省农科院水稻研究所的基地，农妇谭芳（化名）耕种了七年转基因水稻，却从未尝过一粒自己种的大米。这些稻谷最终被销毁，但基地外的市场早已被转基因大米渗透。

转基因水稻的扩散源头之一被认为是华中农业大学。中国农业部仅批准了两种转基因水稻的安全证书，其中“Bt籼优63”的研发者张启发院士被指与武汉科尼植物基因有限公司有关联，该公司委托湖北松滋种子公司制种，部分种子流向了湖北、湖南等地。

研究转基因水稻的机构遍布全国，包括广东、浙江、湖北、北京等地。按照《农业转基因生物安全管理条例》，转基因植物需经过安全性评价阶段，包括实验室、中间试验、环境释放和生产性试验。后两个阶段需与农民合作，但浙江大学原子核农业科学研究所副所长舒庆尧承认，一旦农民看中稻种，制约就难以保障。

以“科丰6号”为例，其研发机构福建农科院与多家单位合作，主栽品种覆盖长江流域、华南多个稻区。福建曾存在相当规模的转基因水稻种子销售市场，但近年来因风声紧，大部分公司已停止销售。然而，四川、湖南、广东等地仍有渠道可获得少量种子。

转基因水稻的扩散几乎不可避免。舒庆尧指出，理论上，一粒种子流出，种植一万亩、十万亩都有可能。克螟稻在浙江上虞的示范田表现优异，农民纷纷留种，种子公司也介入销售。尽管科学家们采取了严格的防护措施，如筑起3米高的围墙和“护城河”，但扩散仍在发生。

转基因水稻的违规种植导致欧盟对中国大米出口采取保障性措施。2009年，浙江省出口欧盟米制品中多次检出转基因成分，尽管经过努力，阳性检出率下降，但仍有17.2%的违规率。2010年，农业部开展了史上最大的种子执法专项行动，首次进行转基因检测，并处罚了违规企业。

然而，中国首批获批转基因水稻“华恢1号”和“Bt汕优63”的安全证书已发放多年，争议依然不断。转基因水稻的扩散问题，仍需更严格的监管和科学评估。