自科技部启动第一批科学数据共享项目以来，我国在科学数据共享运行机制和管理模式上实现了从项目建设到“以用为主、开放共享”的长期运行服务模式的转变。然而，数据共享在政策扶持、人才队伍建设、实际应用和跨学科研究等方面仍面临诸多挑战。

共享理念逐渐普及：过去，科研数据多为少数人或单位使用，但自2002年首批项目启动后，数据资源逐步走向开放共享。中国工程院院士孙九林指出，十多年来最大的收获是共享理念的普及和科技界参与自觉性的提高。中国极地研究中心副书记朱建钢介绍，极地中心自1999年建立极地科学数据库系统，2003年加入地球系统科学数据共享网，通过数据协调员现场跟踪，有效推动了数据共享，并因此获得国家南北极数据中心落户等发展机遇。

社会效益显现：地球系统科学数据共享平台盘活了中科院多年积累的数据，并引进国外资源，如2003-2007年无偿提供26000景陆地资源卫星数据，节省经费约7800万元。平台实名注册用户64993名，为1155项重大科研项目等提供定制服务。人口与健康科学数据共享平台建立了6个科学数据中心，解放军总医院通过远程医疗网络提升了农村医疗卫生服务水平。

诸多问题有待解决：经费支持不足是主要难题，孙九林表示，早期二十万元课题经费已远不能满足当前需求。专家呼吁建设稳定的人才队伍，科技部原副司长腾绵震建议从评价体系上给予政策支持。孙九林强调，数据共享应服务社会经济、企业创新和人才培养，整合数据资源，提升平台性能。尹岭则探索跨学科整合，如利用气象、环境与发病数据预测疾病发生。