来自华南农业大学动物科学学院的研究人员完成了一种高致病性鸡传染性支气管炎病毒株的基因组测序,揭示了该病毒株的分子特征及其基因组的进化动态。这些发现有助于国内鸡传染性支气管炎病毒(IBV)的有效防控,并加深对冠状病毒进化特征的理解。相关成果发表于病毒学权威期刊《病毒学期刊》(Journal of Virology)。
文章的通讯作者是华南农业大学动物科学学院谢青梅副教授,其主要研究方向为动物营养与免疫,曾主持广东省重大科技攻关项目《优质鸡抗病育种研究与开发》的子课题等。
传染性支气管炎(IB)是由鸡传染性支气管炎病毒(IBV)引起的一种急性、高度接触性呼吸道传染病,IBV属于冠状病毒科。近期IBV感染病例持续爆发,在国内呈现高发病率和高风险性,具体原因尚不明确。
研究人员对2004年至2011年期间的疫情爆发进行了监测,分离获得超过300个IBV毒株。流行病学分析表明,鸡肾型IBV毒株日益流行,病毒株之间发生自然遗传重组,导致不同遗传组群的出现,这可能促进了新型IBV毒株的产生。
针对其中一个从2010年存活12天的病鸡样品中分离得到的病毒株——CK/CH/Zhejiang/06/10(IBV-YX10),研究人员进行了深入研究。本文报道了IBV-YX10的完整基因组序列,测序结果显示,这是一种自然基因重组的肾型传染性支气管炎病毒株。
IBV-YX10完整序列共有27,674个核苷酸,组成六个基因,排列顺序为:5′非翻译区(5′UTR)-1a/ab-spike-3a-3b-envelope(3c)-membrane-4b-4c-5a-5b-nucleocapsid-3′UTR。研究证实IBV-YX10在中国发生了基因重组。
这些发现揭示了IBV病毒株的分子特征,并表明IBV基因组在不断进化。这些结果将有助于国内IBV病毒发展的有效控制,并促进对冠状病毒进化特征的深入理解。
华南农业大学今年上半年还曾在Nature Genetics上发表研究成果,张桂权教授指导的博士生王少奎与其他研究人员合作,完成了水稻粒宽基因GW8的图位克隆及功能分析。研究人员从巴基斯坦优质水稻Basmati品种中成功克隆了一个可提升稻米品质和增产的关键基因GW8。在Basmati水稻中,GW8基因启动子变异导致表达下降,使籽粒更为细长,并影响淀粉粒排列结构和垩白度,提高稻米外观和口感品质。而我国大面积种植的高产水稻中含有GW8基因的另一个变异类型,能促进细胞分裂、增加粒重,使水稻高产。研究还发现,来自伊朗水稻品种中的一个新的GW8基因突变类型可将优质和高产性状结合,同时提高水稻品质和产量:将该新等位变异导入Basmati水稻后,在保证优质的基础上产量增加14%;导入我国高产水稻后,在保证产量不减的基础上显著提升稻米品质。(来源:生物通 张迪)