2013年5月30日，《自然》杂志发布了其增刊《2012中国自然出版指数》。该指数显示，2012年度中国作者在《自然》及其子刊上共发表了303篇研究论文，占当年所有此类论文的8.5%，较2011年的7%（225篇）和2010年的5.3%（152篇）显著增长。回溯至2000年，仅有6篇论文有中国作者参与，凸显了中国科研产出的迅猛提升。

该指数进一步表明，中国正迅速成为全球科技论文发表和科研产出的领先力量。全球学术机构论文发表统计将于2013年6月发布，与其他传统科技强国相比，中国的增长尤为突出。增刊深入分析了政府投资、科研机构和城市对中国科研水平快速增长的贡献。

在机构排名中，中国科学院和中国科学技术大学继续稳居前两位，与2011年一致。第三至第五位分别为清华大学、北京大学和上海交通大学。华大基因从2011年的第十位跃升至第六位，表现突出。上海交通大学和浙江大学（从第十一位升至第七位）的高质量科研产出增长也被专题分析。除传统强项物质科学外，中国在生命科学领域的高质量论文产出亦有明显增长。

城市排名方面，北京继续位居第一，上海、合肥、香港和武汉分列第二至第五位。

《2012中国自然出版指数》统计了中国研究机构在18本《自然》系列期刊上发表的文章数量。该增刊内容可在nature网站上免费下载，并包含每周更新的实时排名及2008至2011年的历史数据。