近日,中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室的“百人计划”研究员章张及其团队,与沙特阿卜杜拉国王科技大学(King Abdullah University of Science and Technology)合作,对长非编码RNA的分类问题进行了系统综述,相关论文在RNA Biology发表。
长非编码RNA(lncRNA)是近期发现的一大类非编码RNA,长度普遍大于200个核苷酸,故笼统称之为长非编码RNA。它们在细胞内普遍转录并大量存在,在多个生命过程中发挥重要作用,如基因表达调控、染色质重塑、细胞分化等。然而,与蛋白编码RNA及miRNA相比,lncRNA缺乏显著的序列特征,物种间序列保守性较差,这严重阻碍了大规模生物信息学及功能研究。
为促进对lncRNA生物学特征及功能意义的理解,研究人员从基因组位置、对DNA序列的影响、功能分类、与靶基因结合特征等不同方面探讨了lncRNA的分类,并研究了不同分类方法之间的联系。例如,根据基因组位置,lncRNA可分为基因间、内含子、反义等类型;根据功能,可分为信号、诱饵、引导、支架等类别。这些分类方法有助于揭示lncRNA的多样性和作用机制。
长非编码RNA的准确分类将对特定类别lncRNA的研究、跨类别假设的提出以及lncRNA功能的挖掘提供有力帮助与借鉴,因而在lncRNA研究领域具有重要意义。该综述为未来lncRNA的功能研究和生物信息学分析提供了系统性的分类框架。