2013年初，《中国科学报》发表记者张林就转基因问题对饶毅的专访。饶毅在采访中澄清，他并不认为郎咸平是“学术骗子”，因为郎咸平在转基因和分子生物学方面毫无学术背景，其言论属于造谣而非学术范畴。饶毅指出，郎咸平在电视上公开宣称广西大学生精子下降与转基因应用有关，这是毫无科学依据的谣言。饶毅强调，对于反转基因的极端人士，只要他们确实相信自己的言论，就不是骗子，而是偏执或无知。他呼吁科学家应积极科普，理性讨论转基因问题，避免情绪化表达。饶毅认为，转基因争论的持续反映了中国国民科学素养的不足，若理性社会文化不改善，转基因技术在中国可能陷入困境。他警告，如果转基因在中国失败，将是一个悲剧，中国将继续依赖进口美国的转基因产品。