在973计划的支持下，中国农业科学院蔬菜花卉研究所黄三文研究员团队在黄瓜基因组学研究方面取得了重要进展。研究团队构建了包含360多万个遗传变异位点的黄瓜全基因组遗传变异图谱，为深入了解黄瓜这一重要蔬菜作物的进化及多样性提供了新思路，并为全基因组设计育种奠定了坚实基础。相关研究成果已于10月21日在线发表在国际顶级学术期刊《自然·遗传学》上。

黄瓜作为一种重要的蔬菜作物，因其基因组相对较小，常被用作研究植物或蔬菜经济性状形成的重要模式系统。在本研究中，科研团队对115个黄瓜品系进行了重测序，并对一个野生黄瓜进行了从头测序。研究发现了330多万个单核苷酸多态性位点（SNPs）、33万多个小插入和缺失变异，以及594个获得/缺失变异。基于这些数据，研究人员成功构建了一个单核苷酸分辨率的黄瓜遗传变异图谱。

利用这一遗传变异图谱，科学家进一步证实了黄瓜起源于印度，并将控制叶片、果实大小以及苦味等性状的关键基因定位在了染色体上。这一发现为未来利用这些关键基因进行黄瓜驯化和分子育种提供了重要依据。

此外，973计划于2012年设立了重大项目“主要蔬菜重要品质性状形成的遗传机理与分子改良”，两年来在蔬菜重要性状形成方面取得了一系列突破性进展。黄瓜遗传变异图谱的构建不仅为蔬菜作物的生物学研究提供了宝贵资源，还为我国蔬菜育种的核心竞争力提升和民族种业的跨越性发展奠定了坚实基础。