为了尽快了解今年在西非爆发的、前所未有的埃博拉病毒(EVD)疫情,来自哈佛大学、Broad研究院等多处科研机构的研究人员对超过99个埃博拉病毒基因组进行了测序和分析。这些发现将有助于研发现场快速诊断方法。
这一研究成果公布在8月29日《科学》杂志在线版上。
埃博拉病毒是一种十分罕见的病毒,因其在苏丹南部和刚果(金)的埃博拉河地区发现而得名。今年2月从西非国家几内亚开始的新一轮埃博拉疫情呈现出加速蔓延之势,迄今已有1400多人死亡,约2600人染病。
在最新这项研究中,研究人员收集了此次疫情爆发后第一天里,来自78位塞拉利昂地区被诊断为埃博拉病毒感染的患者的99个样品(部分患者提供了多个样品,以便更清楚地了解病毒在人与人之间传播后发生的变化)。
研究人员在其中发现了超过300个基因突变,这些突变令2014年埃博拉病毒基因组与引发之前埃博拉疫情的病毒区分开来。同时,研究人员也从测序样本中发现,EVD是由单个进入人体的病毒发生突变,开始爆发传播,传染给许多人的。
埃博拉病毒出现的突变主要集中在基因组外显子,即编码蛋白的区域。这项研究发现的一些遗传突变可能会影响PCR诊断试剂中的引物,这表明基因组监控的重要性以及随时保持警惕的必要性。
为了促进这一病毒研究发展,该研究组的研究人员在NCBI上公布了基因组全长序列,以便全球科学家共享这一信息。
过去的埃博拉病毒感染爆发局限于中部非洲,但2014年的爆发则是从西非国家几内亚开始的,并接着蔓延至塞拉利昂、利比里亚和尼日利亚。
此次获得的基因组是通过深度测序技术完成的,将能提高埃博拉病毒四倍以上的基因组数据信息。研究人员还将2014年EBOV的测序数据与早些时候EBOV爆发的20个基因组进行了比较,结果发现今年爆发的病毒可能与之前的疫情病毒具有一个共同的祖先,可以追溯到第一次1976年的埃博拉病毒爆发。
研究人员表示,与过去爆发的疫情相比,此次病毒爆发始于某单个人体病毒的交换突变,然后再通过持续的人与人之间的相互交往而传播,从而将来自几内亚的2个EBOV病毒系传播到了塞拉利昂。
这些研究结果还表明,在疾病流行期间对病毒基因组进行快速测序,有助于疾病防控和靶向治疗。虽然目前这些序列还没有临床上的实际意义,但对于解析这种病毒、遏制其进一步传播至关重要。