中国科学院昆明动物研究所与云南省出入境检验检疫局、上海巴斯德研究所合作，在中缅边境地区发现了一株结构极为复杂的HIV-1重组病毒株。该病毒株包含14个重组位点，由CRF01_AE、B和C三种亚型片段组成，其复杂程度超过以往任何报道。这一发现揭示了中缅边境地区HIV-1遗传多样性的高度复杂性，对疫苗设计和抗病毒药物研发具有重要参考价值。

中缅边境地理位置特殊，高危人群种类较多，包括静脉吸毒人群（IDUs）、性工作者（CSWs）和长途卡车司机（LDTDs）等，使得该地区成为HIV-1感染和传播的重灾区。高危人群在中缅两地频繁往返，加剧了HIV-1的双向传播，促进了病毒遗传多样性和重组的发生。

中国科学院昆明动物研究所动物模型与人类疾病机理重点实验室郑永唐研究员团队前期对中缅边境的IDUs和缅甸籍LDTDs进行了HIV-1分子流行病学研究，发现HIV-1在这些人群中流行种类多样，重组频繁（AIDS, 2012; BMC Infect Dis, 2014）。然而，这些研究基于部分基因片段，未能全面反映重组情况。为充分掌握HIV-1的遗传多样性，周衍衡在郑永唐指导下，对一例缅甸籍LDTD的HIV-1进行了近乎全长基因组分析。结果显示，该病毒株为HIV-1 CRF01_AE/B/C重组株，与东南亚所有已知重组株的重组位点均不相同，且比2003年报道的来自缅甸CSW的最复杂重组株更为复杂。该病毒株含有4个CRF01_AE亚型片段、6个B亚型片段和5个C亚型片段，共14个重组位点。这是自Takebe等人2003年报道缅甸HIV-1近乎全长基因组12年后的首次新发现。

该研究结果近期在线发表于国际学术期刊AIDS Res Hum Retroviruses。中国科学院上海巴斯德研究所张驰宇研究员、云南省出入境检验检疫局梁跃波和覃卫红也参与了研究。研究获国家自然科学基金、国家重大科技专项等项目资助。