真核生物维持正常生命活动依赖于囊泡介导的物质运输,因此囊泡运输机制一直是细胞生物学研究的重点。近日,欧洲分子生物学实验室(EMBL)研究团队利用先进的冷冻电子断层成像技术,首次揭示了COPI囊泡表面蛋白包被的复杂三维结构,该成果发表于2023年7月10日的《科学》(Science)杂志。
蛋白质作为细胞功能的执行者,其合成后需通过囊泡运输系统被精准运送至细胞器、细胞膜或细胞外,保障细胞的生长、分化及稳态。其中,COPI囊泡主要负责从高尔基体向内质网逆向运输蛋白质,支持蛋白质的加工和修饰过程。
研究团队采用冷冻电子断层成像技术,在极低温度下对未固定、未染色的活性囊泡样品进行成像,避免了传统方法中对样品结构的破坏,极大提升了大分子复合物的结构解析精度。该技术近年来随着硬件和算法的进步,已成为解析细胞内复杂蛋白质复合体的前沿工具。
通过整合数百个COPI囊泡的成像数据,研究人员构建了完整的COPI蛋白包被三维模型。结果显示,COPI包被结构与其它囊泡(如COPII和克拉林囊泡)显著不同:其他囊泡的蛋白包被通常由多层蛋白质组成,分别承担不同功能,而COPI包被仅由一层蛋白组成,这层蛋白以被称为“triads”的基本单元排列,每个单元包含所有必需的功能模块。
这一发现首次揭示了COPI囊泡蛋白包被的整体组装方式,深化了对细胞内蛋白质逆向运输机制的理解。研究负责人John Briggs表示:“此前我们仅知包被由多种元件组成,但对其整体组装和空间结构知之甚少,这项研究填补了这一空白。”
共同作者Svetlana Dodonova补充道:“COPI包被的独特单层结构令人惊讶,未来我们将进一步探究包被蛋白与囊泡膜的结合机制,推动对细胞内膜系统动态调控的认识。”