近日,英国《自然》杂志发表了一项关于便携式基因组测序装置在传染病学研究中的应用。研究人员开发了一个可以装入行李箱并运输到现场使用的埃博拉病毒基因组测序监测系统,该系统在收集样本后24小时内就可以得出结果。
在疫情监控中,病毒基因组测序对于了解病毒在大规模传播过程中的变异至关重要,但由于病毒传播速度快,如何快速高效地完成相关分析成为关键。
英国伯明翰大学的尼古拉斯·罗曼和他的团队开发的基因组监测系统,使用的是一个重量小于100克的DNA测序装置,可以通过标准的航空行李运送,也可以插入笔记本电脑的USB接口。研究团队使用该系统测序分析了142个从2015年3月份到10月份收集的埃博拉病毒样本。结果显示,他们可以在24小时内得到分析结果,测序过程仅需不到一小时。
在西非几内亚最近的埃博拉疫情中,该系统被成功用于实时监测疫情。研究人员在埃博拉患者身上收集样本后,在现场利用该系统进行病毒基因组测序,无需将样本运回实验室。
研究团队认为,这一系统在资源有限的情况下进行实时基因组监控是可行的,并且可以在需要时迅速建立以监测疫情。