2016年10月中旬，Illumina公司宣布正在为非洲人类遗传与健康（H3Africa）计划打造一款GWAS芯片。该芯片将包含250万个针对非洲人群的变异位点，旨在填补非洲人群基因组研究的空白。H3Africa计划是美国国立卫生研究院（NIH）、非洲人类遗传学会与威康信托基金会（Wellcome Trust）的合作项目。

“目前H3Africa计划已完成对来自整个非洲大陆3000例个体的外显子组和全基因组测序，并将变异位点提交给Illumina，用于设计GWAS芯片。”Illumina高级市场开发经理朱莉·柯林斯（Julie Collins）表示，“我们正在积极推进芯片的设计与制造，预计2017年初开始发货。”

这款芯片将有助于研究非洲人群的基因多样性及其对环境变化的基因响应，为非洲大陆非传染性疾病的研究开辟新途径。高通量生物芯片技术是Illumina公司发展的第一个里程碑。自2005年推出首款芯片以来，Illumina不断创新，提供经济、高通量且可扩展的芯片解决方案，以满足日益增长的研究需求。人类HapMap计划中超过80%的数据来自Illumina的高通量芯片平台。除人类基因组研究芯片外，Illumina还提供动物、植物基因组研究芯片，以及转录组和表观遗传组芯片的定制服务。

2016年度，Illumina的芯片业务表现优于预期，第三季度收入增长超过35%。芯片订单受到直接面向消费者（DTC）市场和农业客户的“强劲兴趣”双重驱动。微阵列订单增长90%，其中Global Screening Array单项订单金额达200万美元。