对于前列腺癌来说，复杂的基因组重组事件非常普遍，但此前的研究未能充分解析这一问题。二代测序（NGS）技术在检测长度大于1kb的基因组结构变异时存在局限性，而新一代基因组图谱技术（NGM）能够与NGS形成互补，有效解决大片段基因组变异的问题。

日前，澳大利亚研究人员通过结合NGS与NGM技术（基于Bionano Genomics公司的Irys系统），完成了世界首例前列腺癌全基因组的绘制，为深入理解该疾病提供了新见解。该研究选择了标准格里森评分为7分的前列腺癌样本，这是诊断中最常见但临床高度不可预测的一类。

这项研究揭示了此前未检测到的与前列腺癌相关的DNA变化，相应结果发表在《Oncotarget》杂志上。通过前列腺癌全基因组绘制获得的信息可用于描述个体肿瘤特征，揭示以前无法识别的信息，从而使治疗更具针对性。

研究发现的大片段DNA重排事件数量是此前的10倍，并发现了15种新的前列腺癌潜在驱动因子。

Garvan医学研究所Vanessa Hayes教授

该研究负责人、Garvan医学研究所Vanessa Hayes教授表示：“尽管多年来我们一直在研究前列腺癌，但对这些肿瘤的驱动因素了解有限。临床上最大的挑战之一是区分哪些癌症会扩散并危及生命，哪些癌症可以避免损伤较大的临床治疗。为了进行靶向治疗，我们首先需要了解每个肿瘤的驱动基因。”

研究人员使用新的NGM技术与全基因组测序相结合，揭示了迄今为止最全面的前列腺癌全基因组图谱。

对于大多数癌症来说，主要是驱动基因上的点突变或小的插入缺失所引起，而前列腺癌比较独特。此前，我们只了解前列腺癌中少量的小级别遗传变异，然而，目前看来，它更可能是由基因组内大型复杂的DNA重排引起的。

Hayes教授表示，在这项研究中，新的图谱技术与全基因组测序的协同分析非常重要。她说：“我们不能仅使用测序技术完成这项工作。全基因组测序在识别小的DNA突变时非常有用，但是当一个基因完全被删除、转移到另一条染色体上或多次扩增时，测序可能就无法检测到。结合下一代图谱技术，我们发现了大量的大规模重排，然后基因组测序使我们能够鉴定出受这些重排影响的基因。”