2011年5月11日，华大基因（BGI）与荷兰TTIGG（Technological Top Institute Green Genetics）共同宣布启动“100个番茄基因组研究计划”。这是中荷两国科学家在基因组学领域携手合作的又一重要项目，旨在通过大规模测序和深度数据分析，解析番茄基因组序列，为培育高产、优质、抗病虫害等优良性状的新品种奠定基础。

该计划预计耗时1年，完成100个番茄品种的基因组测序与组装，总经费约100万欧元。项目由中荷多家科研机构与企业共同承担，包括华大基因、荷兰分子育种公司、大学及研究院等。荷兰副首相兼经济事务、农业与创新部长Maxime Verhagen、TTIGG主任Bernard de Geus、华大基因执行总裁王俊等出席了签约仪式。

番茄（Solanum lycopersicum）是重要的经济作物，其基因组约950 Mb，包含约35000个基因。此前，首个番茄参考基因组于2012年发表（Nature），而本项目通过大规模群体基因组学分析，可揭示番茄驯化与改良过程中的遗传变异，如与果实大小、颜色、抗病性相关的关键基因。例如，fw2.2、fas等位点控制果实重量，Rin、Nor等影响成熟过程。这些信息将直接应用于分子标记辅助选择（MAS）和基因组选择（GS），加速育种进程。

华大基因执行总裁王俊表示：“该项目将对全面开展番茄的遗传学研究、基因组学研究和分子育种研究提供非常重要的科学价值，对番茄产量的提高和病虫害的防治具有重大意义。”双方还就基因组学成果的市场转化、植物分子育种前景及策略进行了深入探讨，为后续合作奠定基础。

TTIGG是由荷兰多家分子育种公司、大学和研究机构组成的创新平台，经费由荷兰政府经济事务、农业与创新部提供，旨在推动绿色遗传学领域的研发与教育。