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专访林东昕:食管癌全基因组关联研究揭示中国人群易感位点

2011-06-30 01:19 王蕾 生物通 阅读 0
核心摘要: 中国医学科学院等机构通过全基因组关联研究,发现中国人群食管鳞状细胞癌的5个全新易感位点,成果发表于《Nature Genetics》。林东昕教授指出,这些发现有助于阐明食管癌的遗传易感机制,为预警、预防和靶向治疗提供重要依据。研究强调环境与遗传因素的共同作用,并建议不吸烟、不过度饮酒以降低风险。

来自中国医学科学院/北京协和医学院分子学国家重点实验室、南京医科大学、中山大学肿瘤防治中心等机构的研究人员,通过全基因组关联研究发现了全新的中国人群食管鳞状细胞癌(ESCC)易感位点。这一成果对于解析食管癌的分子机理及相关治疗具有重要意义,研究成果发表于国际著名期刊《Nature Genetics》。

领导该研究的是中国医学科学院/北京协和医学院肿瘤医院肿瘤研究所病因及癌变研究室主任林东昕教授。林教授研究组曾系统研究致癌物代谢、DNA修复、细胞周期和凋亡控制、肿瘤免疫等系统的基因变异与食管癌、胃癌、结直肠癌等常见肿瘤发生和发展的关系,在该领域作出了重要贡献。回顾多年的科研道路,林教授坦言:“科学研究很辛苦,且相对其他工作来说比较‘寂寞’,尤其在浮躁的社会环境下要沉心工作不容易。但探索未知也其乐无穷!”

生物通:食管癌是世界上六大恶性肿瘤之一,其中ESCC是最常见的类型,也是我国相对高发的癌症。这项研究在全基因组范围检测了大量样本,发现了5个重要的易感位点,是一项前所未有的重要成果。请问这对于食管癌的基础研究和诊断治疗有何重要意义?

林教授:食管癌从组织病理学类型可分为鳞状细胞癌和腺癌。我国的食管癌主要是鳞状细胞癌,约占95%。对食管癌的病因,国内外以往有许多研究,结论虽不完全一致,但吸烟和重度饮酒是明确的危险因素。此外,暴露于特定化学致癌物、某些营养素缺乏也与食管癌有关。尽管环境因素和生活方式被认为是食管癌的病因,但同样暴露于这些因素的人群中只有少数个体发病,表明食管癌的发生还与患者自身的遗传因素密切相关,可能是环境与遗传共同作用的结果。因此,研究并揭示导致食管癌发生的个人遗传因素至关重要。其重要性在于:(1)阐明食管癌发生的个体内在原因,揭示个体差异,即为什么有的人暴露于危险因素会得食管癌(易感),而有些人则不会(不易感);(2)揭示遗传易感因素有助于该重大疾病的预警和预防,指导易感人群避免不良生活方式和环境暴露;(3)揭示食管癌致病基因对靶向治疗有重要意义,可根据基因产物(蛋白质)开发治疗药物。

生物通:这项研究采用了全基因组关联研究方法,您为何选择这种方法?在实验和分析过程中是否遇到困难?

林教授:全基因组关联研究是目前研究疾病易感基因或致病基因的重要手段,得益于人类基因组计划和国际单体型图计划研究成果以及生物芯片技术。以往常用的“候选基因”方法比较片面,结果可能存在偏倚。全基因组关联研究则比较全面,结果可重复性高。该方法已较成熟,但需要整合多学科,包括分子流行病学、遗传流行病学、分子生物学、生物信息学、生物统计学。我们在研究过程中确实遇到一些困难,解决办法就是不断学习。

生物通:研究样本来自中国人群的2000多个样本,这些易感位点是否也存在于其他人群中?

林教授:我们用于全基因组关联分析的食管癌病例2031个,对照2044个。发现的易感位点经过另外四个独立的大样本量病例(6276人)和对照(6165人)队列验证,分别来源于华北、华中、华东和华南地区。验证结果虽有一定异质性,但合并分析结果一致,说明这些易感位点存在于不同地区的汉族人群。其他民族人群的情况有待验证。

生物通:在这5个染色体区段的变异区域中,有多个区域与吸烟、饮酒有关,也有与乙醛、细胞增殖与凋亡等相关的变异。这是否说明食管癌由多种环境-基因原因诱发?日常生活中如何避免这些因素?

林教授:在所发现的5个易感区段中,只有12q24上的3个位点与吸烟和饮酒有协同作用,其中一个位点位于乙醛脱氢酶-2基因编码区。乙醛是酒精(乙醇)在体内的有毒代谢产物,该酶还参与代谢其他致癌物如多环芳烃。我们的研究结果确实强调食管癌由多种遗传易感因素与环境因素共同诱发。日常生活中,目前能做的是不吸烟、不过度饮酒、避免一些职业暴露。

生物通:您在癌症研究道路上已走过多年,获得了多项重要成果。回首来看,成功的关键在哪里?这段科研道路给您怎样的启示?

林教授:成功的关键我认为有几点:一是确立研究方向后踏踏实实做事,科学研究不能浮躁,要沉下心来认真钻研;二是专业学识;三是精诚团结和多边互利的合作精神;四是要有充分的资金支持。我自己的感受是科学研究很辛苦且相对其他工作来说比较“寂寞”,尤其在浮躁的社会环境下要沉心工作不容易。不过探索未知也其乐无穷!

(生物通:王蕾)

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