尤霞高通量光学筛选蛋白间相互作用

美国加州大学华裔研究人员尤霞发表PNAS文章

来自美国加州大学圣塔巴巴拉分校的华裔研究人员尤霞和同事开发出了一种利用荧光蛋白间的FRET来确定各种细胞类型中的蛋白质相互作用的定量方法，并将此研究成果发表在11月27日的《美国科学院院刊》（PNAS）杂志的网络版上1。

通过将一种靶标受体与FRET接收器、一个大的候选肽配基与一种FRET供体进行基因融合，研究人员能够在大肠杆菌的细胞质中进行最佳的相互作用伴侣的高通量光学筛选。

流式细胞仪方法能够确定出能够识别细胞内环境中靶标受体的一组肽配基。对SH3和PDZ的domain-type靶标受体来说，生理学上具有相同意义的序列在分离的配基中很明显。这种相互作用伴侣的相对的分裂常数能够通过对含有FRET杂交的细胞溶解产物进行一系列稀释来测量，从而提供了之前没有记载的、能够排列许多相互作用伴侣之间亲和性的高通量方法。  FRET杂交相互作用筛选则为发现细胞中可能对各种真核细胞具有重要意义的蛋白质配基提供了一种强大的工具。

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1            You  X,  Nguyen  AW,  et  al.,  Proc  Natl  Acad  Sci  U  S  A.  2006  Nov  27;  [Epub  ahead  of  print]

Lab:

Department  of  Chemical  Engineering,  University  of  California,  Santa  Barbara,  CA  93106;  and  Bauer  Center  for  Genomics  Research,  Room  208,  Harvard  University,  7  Divinity  Avenue,  Cambridge,  MA  02138 (责任编辑：泉水)

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