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超级计算机模拟肺炎抗药性

时间:2005-09-28 09:32来源:生命科学研究快报 作者:bioguider 点击: 344次
科学家已利用大型计算机模拟技术来确定肺炎病源体如何抵抗药物。

这种认识可以帮助研究者设计出新的药物。肺炎每年导致350万人死亡,大部分在发展中国家。而且肺炎对现有药物的抗药性越来越强。

肺炎链霉菌对药物的抗性来自于一个蛋白质的遗传变异。这个变异位点远离药物通常作用于该蛋白的部位,所以科学家对细菌如何避开药物攻击没什么了解。

英国伦敦大学学院(University  College  London)Peter  Coveney领衔的研究小组为该蛋白建立了一个三维模型。他们用其它三种含相同蛋白质的细菌的有关信息,和有抗性的变异肺炎链霉菌放在一起分析,用计算机模拟抗性菌种和治疗肺炎的药物如何相互作用。研究小组发现变异株的蛋白形状产生了一个微小的变化,并认为这是该菌能抵抗药物的关键。模拟表明,药物可以和普通菌株内的该种蛋白紧密结合,而变异菌株中该蛋白的微小形状改变致使药物不能与之结合。如果进一步实验证实了计算机的模拟结果,则可以帮助设计针对变异菌株的新药。该小组目前正在对HIV药物抗性问题进行研究。

实验通过英国“e—科学”计划完成。该计划利用分布在各地的计算机组成一个“超级计算机”。用这种方法共享资源可以进行“本来要耗时几个月甚至根本无法完成的研究”,Coveney说。

研究小组在Philosophical  Transactions  of  the  Royal  Society(8月15)发表了文章。



(江洪波  摘译自http://www.scidev.net/News/index.cfm?fuseaction=readNews&itemid=2292&language=1 (责任编辑:泉水)
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