454测序法灵敏检测含量稀少突变株

        454生命科学公司（454  Life  Sciences）、罗氏集团和一位耶鲁医学院研究院6月15日宣布，他们利用454公司的基因组测序系统，在一个早期经过临床治疗的样本中鉴定无法检测的稀有抗药性HIV突变。结果公布于巴巴多斯岛举行的第16国际HIV药物耐药会议，证实患者体内携带抗性突变的片段至少比之前预测的多两倍。大部分低水平的突变是现有的临床使用的抗性检测方法所检测不到的。Ultra  Deep测序法检测到的低水平的抗性突变极为重要，因为这些突变帮助预报早期抗病毒治疗失败，预测准确度非常高。

        耶鲁大学医学院和VA  CT  卫生保健系统的Michael  Kozal率领研究小组，对258名HIV感染个体接受药物治疗之前的血液样本的盲回溯分析（blinded-retrospective  analysis，生物通编者译）。Kozal说，现在临床使用的基因型抗性技术只能够检测到占总量20％或以上的抗性突变。因此，现在临床使用的技术遗漏了许多低表达水平的抗性HIV病毒株，这些病毒株在药物筛选压力下能够快速生长，导致治疗失败。这种回溯研究明确证明即便抗性突变的水平不到1％，也会导致治疗过早失败。临床医师有望利用这些研究结果选择更好的抗病毒药物化合物，有效抑制抗性HIV株。

        尽管治疗HIV已经取得了很大成功，但许多患者在治疗不久就产生了药物抗性。早期治疗效果失败的原因是患者感染了药物抗性细胞株还是治疗反应中产生了突变株？454生命科学公司与耶鲁大学合作，对258位患者的血液样本进行了FIRST研究，对比三种不同途径的抗病毒治疗效果。FIRST研究共进行了5年，评估三种初期抗病毒药物对自HIV感染患者的长期临床效果和virologic效果。明尼苏达州立大学CPCRA统计中心收集患者的测序结果，这些数据是不对454生命科学公司公开的。

        454生命科学公司研究和发展部副部长Egholm  Michael博士说，454测序能够立即精确阅读产生成百上千长克隆序列，灵敏检测稀少突变。Ultra  Deep测序法为研究、治疗病毒疾病提供了一个基本工具。（生物通  小粥） (责任编辑：泉水)

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