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Reference manager 9.5中文说明书

时间:2004-03-31 23:15来源:生物导航网 作者:bioguider 点击: 2287次

Reference manager 9.5中文说明书

翻译者: 宋厚辉(记住这个伟大的名字吧)

笔者注:本文及提供的下载文件来源于网上,尽管目前RM已经发展到了第10版,但此文对初入门者仍有很大的帮助。在此,将其原文以在线阅读的形式向各位网友提供,同时,感谢宋厚辉老师为我们提供了如此好的生物医学软件说明书!
一:about reference manager
功能:
1.随时为著作文本或目录提供固定化格式
2.创建并支持本地数据库
3.为以后的再次版印提供方便
4.可以使图书馆或研究机构的人员方便的管理当前服务
5.从各种在线数据库、CD-ROM、或基于web的数据库收集参考文献目录
6.为学生创建学科保存和阅读列表
7.为员工创建出版物列表
8.特殊目录收集
二.打开样本数据库(Open sample database)
用窗口上方的open打开sample.rmd,打开后发现文件由上下两个窗口区域组成。上方为编辑区,以文摘的形式显示,不过显示的内容都是下方所选ID的内容。默认的参考文献列表显示ref
ID, Author, title(如下方窗口所示)。当然这些内容都可以自己定义。
三.参考文献列表显示的用户化定义(Customize the Reference List Display)
在菜单栏选择tools——Reference List Display。出现Reference List fields to
Display对话框,第一行可以指定显示的顺序,第二行可以修饰以标题形式显示的文本,第三行可以选择用户浏览区(点击第三行可以出现上下栏菜单,可通过此菜单选择)。
改变顺序的方法是(比如将第三栏移到第一栏):将鼠标移到第三栏处,当鼠标箭头变成向下的黑体箭头时,按下鼠标拖动即可(拖动方式类似word 文档)!
插入一栏可以点击Insert Col或直接在number of
colum方框内入所需要的栏数。新插入的栏都以ID作为默认的标题(header),可以按上述方法修改。
最后点击OK,此时屏幕提示whether you would like to copy this reference list format to
all reference lists,点yes,以后参考文献的显示就按照用户定义的格式。
栏宽的调整:类似word中表格的拖动,只要会用鼠标就会拖动调整。
三.数据库选择顺序的用户化定义(Customize the Database Sort Order)
1.在已有的数据库中定义搜索顺序:菜单Tools——选择 Change Database Sort
Order。现在定义是的sample数据库,用户可以通过下拉式菜单定义库选择顺序、升降序(比如作者,升序)。最后按sort,系统会自动按用户定义的格式搜索一遍,按close关闭。此时发现下面的窗口不是按ID升序排列,而是按作者进行升序排列。
2.对于新的数据库,通过file——new database——advanced 定义
3.选择顺序的瞬间改变(Change the Sort Order
Instantly):提供这种功能确实很酷,用户通过点击标题栏的ID(下面的那个窗口)就会发现,用鼠标点一次是升序,再点一次立马变成降序。点击其他栏目都会有类似的效果。
四.库间参考文献的拷贝和转移(Copy or Move References from One Database to Another)
注意此操作需要同时打开至少两个数据库,以创建新库为例:
1.菜单file——new database,输入库名(比如test),然后点new保存。
2.窗口下方会出现两个文件名sample 和test,点击窗口下方的sample打开。选中列表中的记录,如果需要选中多条,可通过shift
(或ctrl,用过word人都知道)辅助选择,当选中多条记录时,sample上方的窗口会变成空白(因为上方的窗口以次只能显示一条记录)。移动时直接用鼠标将选中的记录从sample拖到test即可,如果移动三条记录则sample中将丢失三条(当然是被你移到test库中了)。如果不想让sample中的数据丢失,当然用拷贝命令了,方法如下:在用鼠标拖动的同时按住ctrl键即可(如果不按,就是移动)。
当然,这项工作也可以通过菜单Reference ——Copy Between Databases来完成,不过要麻烦的多哟。
五.创建参考文献管理数据库(Building a Reference Manager Database)
1.从internet上搜索(首先电脑必须能拨号或通过其他方式上网,注意对于拨号连接,搜索完成后需要用户自己断开连接,因为reference
manager
不会自动挂断)例如:利用internet搜索OVID技术公司提供的medline数据库(仅仅是全部medline医学数据库的一小部分)。
操作如下:菜单References——Internet Search。出现Retrieval 窗口,通过下拉式菜单选择数据库,选中Z39.50
sites。
A.选库:如果以前没有选择过Z39.50,也会显示Internet Host对话框。请点击hosts左边的小按钮。屏幕会出现Internet
Host对话框,点下方的clear
marks按钮,取消以前选择的数据库。找到ovid,或者在键盘上敲一下字母O,光标会自动移到以O开头的host上。点Ovid-Trial
Server,又会出现一个下拉式菜单(类似于在windows资源管理器中的文件夹),找到Medline Practice
Demo,其他的不要选了。点击Marked Host,屏幕会出现一行Ovid-Trial Server-Medline Practice
Demo(这就是我们要选择的数据库),最后点击OK(在中文系统中为确定)。回到retrieval窗口,此时Ovid-Trial
Server-Medline Practice Demo就出现在hosts的由侧。
B.定义搜索表达式:在field栏中键入any(此时会自动出现下拉式菜单,选中anyfield),在Parameter框内键入要搜索的关键词,按F12自动搜索(或者按菜单上面的“望远镜”符号),对于拨号上网,系统会自动拨号(但不会自动断开)。如果连接成功屏幕会显示搜索结果(别忘了把需要的参考文献移动到新库中),如果连接失败(尤其是局域网)很容易失败。屏幕会出现错误信息。
如何通过代理服务器连上网络:在刚才的窗口中请点击hosts左边的小按钮,在出现的对话框中点configure
hosts,然后出现一个对话框,在对话框右边看到proxy server 没,点它。出现proxy server
properties窗口,在proxy server protocol 栏中,选socks V5(默认状态是not using a proxy
server,也就是默认的是拨号上网方式),在proxy
server栏中输入本局域网的代理服务器IP地址(比较难,如果用户以前通过代理用OICQ聊过天,就知道这个IP地址的设置和QQ一样,如果不知道,就请教周围的高手吧)和端口port,在proxy
server will perform
DNS上打钩,然后输入本机上网用的用户名和密码(如果本人所处的局域网很牛逼,是清华或上海交大的,可以不用上网密码,如果本人的局域网只是小屁屁一个,比如浙江大学,还是老老实实的把你的用户名和密码输进去算了。)
C.如果搜索的结果太多怎么办?当然是重新定义搜索表达式。
菜单References —— Internet
Search,第一行是刚才定义的,不要动。在Connector的第二行输入A,屏幕会弹出下拉式菜单(AND, NOT,
OR),选中AND;在field的第二个框内输入K(通过下拉式菜单选中keywords),在Parameter第二行输入另一个限制关键词(凡是到过图书馆查过资料的人都明白)。点中望远镜Start
Retrieval(或F12),重新搜索。(注意同样的表达式搜索的结果可能不同,当然是鬼子每天都在更新数据库的缘故)。将结果中的重要部分拖到自己定义的数据库中,如果全部都想要,File——>Save
As即可。如果一个都不想要,直接关闭即可(系统会提示是否保存,当然是no),(要是拨号上网的千万别忘了断开连接,RM的最大缺点就是完成后不会自动挂断)。
尽管许多Z39.50
databases都是免费的,但并非每个网络都能连上。在下列三种情况下可能出现无法连接:一,数据库在更新的时候;二,用户所在的网络限制禁止连接商业端口(好多数据库都是建立在商业端口上的),特别是局域网。三,有些数据库是付费的(需要输入用户名和密码)。
六.参考文献的输入(Import References)
通过RM预设计的输入过滤器可以将用户所在机构提供下载的参考文献ASCII文本文件输入到用户指定的数据库中。首先从数据库服务机构下载记录(比如是从PubMed下载的)。
1.打开两个数据库表格sample和test
2.References——> Import Text File,出现Import Text File对话框。
3.利用下拉式菜单选择test数据库(这个数据库是刚才自己定义的,名称随便定),注意文本文件将要输入这个库中。
4.在Filter下拉式菜单的右侧点击[…]按钮选择软件预设计的输入过滤器文件(默认在Reference Manager
9/Import文件夹中),选中PubMed.cap文件。
5.在Text下拉式菜单的右侧选择[..]按钮找到Text File所在的目录(默认在Reference Manager
9/Samples文件夹中),找到PUBMED.txt,打开。在Reference
Range栏中输入参考文献范围(all或自己定义,类似于打印文件,有些人喜欢全部打印,也有些人喜欢只打印其中的几页)。在Default
Reprint Status栏中选择“再打印”状态(In File, Not In File and On
Request),可以使系统自动跟踪文件。On request主要是跟踪再打印的日期,选中此项后下面的方框内显示的是当前日期。
6.Additional
Keywords栏的作用是在整个输入的参考文献中添加通用关键词,将鼠标移到第一个方框内,输入PubMed,此时随着键盘的输入在方框的下方会自动出现下拉式菜单(和文献中的内容对应),如果输入的内容(pubmed)出现在动态列表中按enter即可,如果没有按Tab键进入下一个方框输入关键词。也可以根据方框最下面的F或a或?改变输入的关键词的形式(还是F最好)。最后点击“import”将文本文件输入数据库中,输入完成后OK(确定),屏幕将显示输入结果,按close关闭。此时会发现当前窗口中又出现了一个以Imported命名的表格,其实该表格已经输入到用户定义的test文件中了,用户如果需要可以对其进行修改。
七.插入新的参考文献(Insert a New Reference):
主要针对键盘输入而言,比如论文、会议性文章等。其Authors, Keywords and
Periodical格式是基于已有的数据库,并可以进行动态关联。
1. 点击窗口下面的sample文件,激活样本数据库
2. 菜单Reference ——> New,进入Reference Edit窗口。
3. 第一栏为Ref.
Type,通过下拉式菜单来实现。注意journal和journal(full)的区别,前者指的是在journal内输入文章,后者指的是整个journal而不是文章。
4. 利用鼠标或Tab键依次输入内容,注意:Ref ID是按照进库的顺序由系统自动编号。
5. 在title栏中输入题目,不要加标点符号,斜体字可以最后利用输出类型(output type)进行修改
6. 在author栏中作者的格式是Song H H;
7. Pub Date默认时间是计算机的当前时间,自己可以修改。在other栏中可以输入summer等,随自己的爱好。
8. Web/URL栏中输入文献的网页连接,
9. 一步步的操作,最后保存,并关闭
10. 对当前显示的记录修改时,可以通过上面的窗口修改,也可以通过双击下面的记录弹出整个屏幕进行修改
八.参考文献拼写检查
除了authors
和periodicals之外,RM对选中的单词或句子都可以进行拼写检查。选中要操作的单词或句子,按菜单栏上的abc按钮进行拼写检查,或者用tools——>Spell
Check.如果有错误按change键修改。
九.创建搜索策略(Create a Search Strategy)
搜索包含以下项目:
field:可以选择一个或一组(比如作者)
Parameter:可以输入一个单词或句子
Connector:可以在搜索时借助AND, OR, or NOT来限制范围
操作如下:
1.打开sample 和test数据库,打开菜单References——> Retrieve, 显示Retrieval 窗口,并发现Internet
Search左边的方框没有打钩(表示在本地库内搜索)
2.利用下拉式菜单选择All Databases或者某一个特定的数据库
3.将鼠标移到Field的第一行,并输入K,则keyword自动进入空格内(当然用户也可以自己选择)
4.按Tab键将光标移到Parameter栏中,输入dolphin或其他关键词,如果此词在库中有,则会自动弹出下拉式菜单,用户可以结合鼠标和enter选择,然后在dolphin后面输入一个*(星号),表示系统会自动搜索各种dolphin的变体,如dolphins、dolphining等.如果想缩小搜索范围,这一栏输入AND,将多个关键词连起来。不过当在同一栏中输入多个关键词时,要用大括号{}隔开,如{dolphin*}
AND {behavior}。
5.在connector的第二栏选择AND,在field栏输入Y,则year自动弹出;在parameter输入1998或其他年份(也可以是一个范围,如1998-2001)。
6.点击望远镜符号(或F12)搜索
7.搜索结果Results在屏幕的右侧(符合条件的记录用数字显示),用户可以点击该数字查看具体信息。
十:搜索策略的保存(Save a Search Strategy)
主要针对用户常用的策略
1.打开菜单References——> Retrieve, 显示Retrieval 窗口(显示的是刚才定义的搜索策略)
2.点击望远镜[start Retrieval,F12]右侧的小望远镜(鼠标移动到此位置时会出现Strategy Files),犹豫什么,点它。
3.在出现的对话框中点save,又会出现一个小对话框(当然是叫你给这个文件起个名字拉),输入fuck (什么都行,只要你喜欢),OK。
4.如果你再打开strategy files时,则fuck已出现在弹出的窗口current strategy中了,点load调用。
十一:专业术语列表管理(Managing Reference Manager Term Lists)
整体编辑术语列表(Globally Editing Term Lists)方法:
1.先激活sample数据库,然后Term
Manager——>active。首先显示的是Keyword列表。用户可以在窗口的上方看到Sample(表示当前操作的数据库,用户也可以通过工具条选择其它数据库)。
2.点Author,显示Author列表,选中ANTHONY,K.
3.Term Manager——>Global Edit,出现一个窗口,在Destination栏中输入Anthony,
K.,点Replace,这样数据库就知道原来的鸟人ANTHONY,K写错了,点OK,以后ANTHONY,K这个鸟就不存在了,当然是被
Anthony, K.代替了,你再看看左边的列表,果真如此。当然,如果用户不喜欢这个鸟的话,也可以Delete。
创建同义词(Create Synonyms)
1.Term Manager ——> Activate
2.找到keywords中的east-coast,注意紧挨着east-coast还有一个单词east
coast,用shift(或ctrl)和鼠标将这两个单词选中。
3.Term Manager ——>Combine Terms.这时数据库就知道原来east-coast和east
coast是同义词。不信你看看表格,上面写着呢。
拷贝期刊列表(Copy a Periodical List):
期刊列表中每个期刊含有四个同义词,分别是全称、标准简写形式、和两个用户自定义的名称。特别是当用户创建新库的时候,这些期刊都要手工输入(不累死你才怪)。既然数据库已经提供了许多期刊(化学、人类学和医学),拷贝过来算了。方法如下:
1.Term Manager ——> Activate,点中Periodical。
2.Term Manager ——Copy Periodicals,出现Copy Periodical对话框
3.在Copy对应框内,点下拉式菜单,选Medical,此时下面的select框变黑。OK
4.此时periodical显示的全是和医学有关的期刊,用户可以点击自己熟悉的期刊查看该期刊的全称和简称(在将来发表文章的时候可能用到,因为不同的出版社要求的格式不一样)
十二:通过专业术语列表再重新利用参考文献(Retrieve References using Term Lists)
1.Term Manager ——> Activate,点中Keywords
2.找到animal behavior和 animal communication,借助shift和鼠标将二者选中
3.Term Manager——> Quick Retrieval,(或者点望远镜F12)
4.在出现的对话框中选OR
5.显示重新搜索的结果
十三:在word加工器中建立参考目录(Building Bibliographies in Your Word Processor)
1.同时打开一个新的word文档和reference manager, 在word文档中,点工具(tool),马上发现Reference
Manager 9已经在安装的同时自动嵌入word文档的工具栏中了。放心调用吧!!(有9种功能呢)。
2.确定引用的参考文献(Identify References to Cite)方法1:在新文档中输入Its easy to Cite While
You Write with Reference Manager,点Tools ——>Reference Manager 9 ——> Insert
Citation,出现对话框。在identifying
text栏中输入dolphin,在look栏中输入此文献所在的数据库(如sample),然后点insert。这时库中符合条件的记录以列表的形式显示出来。如果符合条件的记录很多,而且查找不方便,可以再缩小查找范围重新查找。很简单,就是在上面的identifying
text栏中dolphin的后面输入1996(dolphin
1996之间用空格隔开),然后点方框右侧的放大镜图表搜索,则符合条件的记录比刚才少多了。用户可以选中某个需要引用的记录(如果同时插入好几条,结合shift选择),点insert。(注意:word文档中的tools——>
Reference Manager 9——> Recall Last Search,点点看,会出现什么现象。哈哈,当然是刚才显示的文献列表喽)。
方法2:在word文档中输入Search and mark references in Reference
Manager,然后切换到Reference
Manager窗口,通过点中左边的方框选中一条或几条记录。在切换到word文档,将光标移到刚才输入的句子后面,点Tools ——>Reference
Manager 9——> Insert Marked References。哈哈,刚才选中的记录自动引用上去了。
方法3:在word文档中输入Identify text in your manuscript and later scan the document
to add Reference Manager place holders said Connor. {connor /d;
behavior},选择工具 ——> Reference Manager 9 ——> Scan
Document,注意对话框中左右两边的界定符号是大括号{}(表示扫描的是大括号中的内容),然后点中对话框中的Identifying Text
(separated by
semi-colons),按OK。在显示的列表中找到connor对应的记录,点insert,然后在找到behavior对应的记录,点insert。至此扫描结束。
3.根据引用格式在word文档中创建对应的参考文献目录(Generate the Bibliography)
方法一:在word 文档中点Tools ——>Reference Manager 9—— > Generate
Bibliography.在对话框Output Style中点右边的[…],在弹出的Reference Manager 9/Styles
目录中选择一种输出类型(就是你要投稿的那个期刊,当然要按人家的格式来了)。找到American Psychological Association
,(同时用户可以对参考文献的输出格式进行调整)。最后点OK确定。
如果用户对刚才的输出结果不满意,尤其是发现输出的参考文献行距太大或者没有标上数字,用户可以重新设定。方法:Tools ——>Reference
Manager 9—— > Generate
Bibliograph,看到对话框中的reset按钮了没,就是它,点中。然后随心所欲的设定吧,一遍不行可以再来一遍。方法二:直接在reference
manager窗口中创建,Bibliography—— > Generate from Reference
List,点开后发现出现的对话框和方法一的一样,用户看着办吧。
终结者:reference manager9.5的中文说明书到此就翻译完了,下个目标就是reference
manager10版,不过会用9.5版的人一定会用第10个版本!
如果各位仁兄有什么建议或者需要各种生物软件的中文说明书请发email给我:songhouhui@yahoo.com.cn
特此声明:凡是我翻译的各种生物软件说明书,都是免费的,不得用于商业用途!若发现,将摧毁其所在的网站!(哈哈,玩笑)

(责任编辑:泉水)
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