Nat. Biotechnol.:新基因组测序方法能够在单细胞水平上分析基因表达谱
时间:2012-07-24 16:06 来源:生物谷 作者:生物谷 点击:次
生物学家和遗传学家长期以来希望在单个细胞水平上分析基因表达谱,但技术限制一直阻碍其实现。根据2012年7月22日在线发表在《自然·生物技术》(Nature Biotechnology)期刊上的一项研究,研究人员首次证实一种名为Smart-Seq的新型基因组测序方法能够帮助科学家对临床重要性的单个细胞进行深入分析。Smart-Seq可能具有多方面应用,包括帮助科学家更好地理解肿瘤的复杂性。这一点至关重要,因为许多临床重要性的细胞数量稀少,需要进行单细胞分析。 此前研究表明,单个基因常通过不同的剪接配置产生同种蛋白的多种形式。这种被称为可变剪接的现象意味着来自同一组织的细胞并不像人们之前想象的那样同质化。在这项新研究中,研究人员开发出一种方法,能够完整绘制单个细胞的基因表达谱。通过显示哪些基因具有活性,科学家可以精确描述和研究来自同一组织的单个细胞之间的基因表达差异。 研究中,研究人员分析了患有复发性恶性黑色素瘤患者血液中的肿瘤细胞。一旦在常规血液检测中鉴定出肿瘤细胞,他们便利用Smart-Seq分析其基因表达谱。通过这种方法,研究人员证实肿瘤细胞激活了许多重要的膜蛋白,这些蛋白被认为负责逃避体内监控系统,并在血液或淋巴中扩散。 (责任编辑:泉水) |
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