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NIH投入9000万美元推动单细胞技术发展

美国国立卫生研究院(NIH)宣布,未来五年将投入超过9000万美元,用于开发单细胞分析工具。这笔资金来自NIH共同基金,将资助26个项目,作为其单细胞分析计划(SCAP)的一部分。单细胞技术近年来被《自然·方法》杂志列为值得关注的技术,因为细胞异质性在生物学和疾病研究中至关重要。

为了深入解析每个细胞的独特性,15个高风险SCAP项目将开发新技术,探索蛋白质组、蛋白活性、基因、染色体及其他细胞特征。另外8个项目将验证单细胞分析的原型技术,推动其从实验室走向临床。例如,麻省理工学院化学工程系副教授J. Christopher Love获得两项资助:一项开发芯片上的纳米级区室分离单个细胞,用于分析少量组织样本(如HIV感染中的黏膜组织,仅含10,000-100,000个细胞);另一项利用DNA条形码追踪单细胞转录本,提高分析通量。

德克萨斯大学M.D. Anderson癌症中心助理教授Nicholas Navin获得25万美元,开发单细胞全基因组测序方法Cell-seq。该方法通过诱导单细胞复制基因组,在细胞质分裂前分离,获得四个拷贝作为扩增模板,用于测序。Navin计划将其应用于人肿瘤样本,研究乳腺肿瘤的克隆多样性。尽管面临细胞分离和验证的挑战,团队已优化使用流式分选分离细胞核,并在同一管内完成所有反应以减少起始材料损失。然而,数据分析成本仍是瓶颈,Navin表示“每个细胞都是一个人类基因组计划”。

此外,多家公司已推出单细胞分析产品。瑞士MMI公司的CellEctor Plus单细胞分选系统和CellCut Plus激光显微切割系统可从组织切片、血液等样本中获取单细胞;Fluidigm的C1单细胞全自动制备系统基于微流体技术,可快速分离单细胞并进行基因组分析。这些技术将推动单细胞组学在癌症、免疫学等领域的应用。

(责任编辑:泉水)