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目前，中国农业面临耕地锐减、水资源匮乏、病虫害频发等重大挑战。发展转基因技术可有效缓解这些问题：提高作物产量、减少农药化肥使用、开发功能性食品、建立自主生物技术体系。

国际上转基因作物研究已有30年历史。美国是种植面积最大的国家，2012年达6950万公顷，其次为巴西、阿根廷、加拿大、印度和中国。中国2012年种植面积为400万公顷，近十年增长趋缓。全球转基因大豆、玉米、棉花和油菜的种植比例分别达81%、35%、81%和30%。近期将推广抗旱玉米、氮高效利用玉米及富含β-胡萝卜素的金水稻。1996-2011年间，转基因作物使产量增加982亿美元，减少杀虫剂4.73亿千克，减排二氧化碳231亿千克。

中国转基因研发分两阶段：1986-2000年追踪前沿，进行基因克隆和田间试验；2001年至今自主创新，推进商业化生产和基因组测序。首批商业化品种包括抗病毒番茄、耐储存番茄、抗病毒甜椒、矮牵牛和抗虫棉。其中抗虫棉成效显著：2008年种植面积占全国72%，国产份额从1999年7%升至2008年93%，累计推广2.2亿亩，减少农药80%，增收节支400亿元。

中国在转基因抗虫水稻和转植酸酶玉米方面领先，已通过安全审批。此外，生产人血清蛋白的转基因稻米、抗虫抗旱玉米、抗病毒小麦等已完成产业化前期工作。重要基因克隆方面，中国获得了IPA1、gl-7(t)、Ghd7、Bph14等关键基因。基因组学研究参与国际水稻基因组计划，独立完成籼稻基因组，并完成马铃薯、大豆、黄瓜、杨树、番茄及小麦D/A基因组测序。深圳华大基因已成为世界最大测序中心。

未来，企业将成为转基因育种主体。中央一号文件连续强调种业和生物技术，国务院八号文件明确种业发展意见。中国需通过自主研发增强竞争力，避免重蹈大豆产业覆辙——1995年中国大豆产量1600万吨，2012年降至1260万吨，而美国、巴西、阿根廷因采用转基因大豆产量大增，中国从出口国变为进口5838万吨，榨油产业被外资控制。抗虫棉的成功表明，结合三系杂交技术可提升产量和品质，应对国际竞争。