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从湿实验转行到干实验:生物信息学为实验科学家开辟新路径

随着生物信息学和计算生物学的迅猛发展,许多传统实验研究者对这些新兴领域感到既好奇又陌生。然而,一些勇于尝试的学者已成功从传统实验研究转向生物信息学,为自身职业发展开辟了新方向。《自然》杂志近期关注了这一趋势,通过真实案例展示了转行的可能性与优势。

在生物医学研究中屡遭挫折的年轻学者,或许可以考虑转向生物信息学。尽管他们可能担心缺乏计算机和数学基础,但事实证明,这种转型往往能带来意想不到的收获。干实验为实验室研究者提供了一种全新的职业路径。

Sarah Hird在2005年至2008年攻读硕士期间,对实验室工作深感厌倦。她的研究涉及红尾花栗鼠的分类,分子生物学实验的不确定性让她备受煎熬。她曾花费六周时间试图扩增花栗鼠DNA的重复序列以区分种群遗传差异,却一无所获。在尝试更换试剂、PCR仪和重新制备样品后,实验才意外成功。这种经历在分子生物学研究者中并不罕见。最终,她因厌倦这种令人沮丧的研究而放弃了攻读博士学位。

硕士毕业六个月后,Hird在路易斯安那州立大学担任兼职技术员,并在此发现了新的职业方向。她的实验室PI建议她学习一门编程语言以参与研究项目。尽管从未接触过编程,但通过书籍和在线教程,她迅速入门并沉迷于算法,发现计算机程序比实验室工作更可控。

Hird决定继续科研,但转向干实验——即通过编写软件和开发模型来分析数据。在攻读路易斯安那州立大学进化生物学博士学位期间,她开发了多个程序并完成了博士论文。为加强编程技能,她重修了大学计算机课程并参加了暑期软件开发培训班。如今,她已在加州大学从事博士后研究,专注于细菌基因序列的计算分析。

Hird的成功转型表明,即使没有正规计算机背景,实验研究者也能胜任计算生物学工作。生物信息学和计算生物学的学习资源丰富,包括培训网站、论坛和培训班等。

人们往往不愿改变专业和习惯,但俗话说“人挪活,树挪死”,调整专业可能比想象中容易。例如,一位物理学背景的师姐转行神经生物学后表现出色;发现DNA双螺旋结构的克里克也是从物理学转行生物学。此后,许多物理学家相继转向分子生物学和神经生物学,并取得卓越成就,如著名神经生物学家蒲慕明。

与传统湿实验相比,干实验具有多项优势:无需大量经费投入,灵活性高,可随时启动新项目,且即使成为PI也能亲自参与研究。而传统实验的PI往往转向管理,很少有时间亲自实验。当然,计算生物学也有局限,例如其结果可能被认为不如传统实验真实。但对于希望在多领域灵活开展研究的人来说,干实验无疑是一个理想选择。

(责任编辑:泉水)