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分子地图揭示流感病毒劫持人类细胞的全过程:新机制为抗病毒药物研发开辟新路径

流感病毒每年在全球范围内导致数十万人死亡,其快速变异能力使得疫苗和现有抗病毒药物效果有限。近日,欧洲分子生物学实验室(EMBL)的研究团队在《自然》杂志上发表了一项里程碑式研究,他们利用冷冻电镜和定量蛋白质组学技术,首次绘制出流感病毒在人类细胞内建立“复制工厂”的完整分子地图,揭示了病毒如何劫持宿主细胞的RNA加工机器来高效复制自身基因组

病毒复制工厂的分子架构

研究团队首先通过冷冻电镜技术解析了流感病毒NS1蛋白与宿主细胞RNA加工复合体(包括CPSF4、PABPN1等蛋白)结合的高分辨率三维结构,分辨率达到3.2埃。结构分析显示,NS1蛋白通过其N端RNA结合域和C端效应域,同时与宿主细胞的mRNA加工机器和病毒RNA聚合酶复合体相互作用,形成一个稳定的“病毒复制复合体”。该复合体能够劫持宿主细胞的转录后加工系统,优先处理病毒基因组的复制和转录,同时抑制宿主细胞的抗病毒基因表达。

进一步的蛋白质组学分析鉴定出超过200种宿主蛋白被病毒招募到复制工厂中,其中包括多种RNA结合蛋白、剪接因子和核转运蛋白。研究团队通过基因敲除实验验证了其中15种宿主蛋白对病毒复制至关重要,其中一种名为SRSF1的剪接因子被敲除后,病毒滴度下降了超过1000倍,表明该蛋白是病毒复制不可或缺的辅助因子。

劫持机制与宿主防御的博弈

研究还发现,流感病毒通过NS1蛋白抑制宿主细胞的干扰素应答通路。具体而言,NS1蛋白与宿主细胞的RIG-I样受体信号通路关键蛋白TRIM25结合,阻断其泛素化活性,从而抑制干扰素调节因子IRF3的激活,使宿主细胞无法启动有效的抗病毒免疫反应。这一机制解释了为何流感病毒能够迅速在宿主细胞中建立感染。

“我们的研究首次在分子水平上展示了流感病毒如何像一个精密的分子机器,系统性地劫持宿主细胞的多个关键通路,”该研究的通讯作者、EMBL的Anna K. H. Müller博士表示,“这些发现不仅加深了我们对病毒-宿主相互作用的理解,还为开发针对病毒复制复合体的新型抗病毒药物提供了多个潜在靶点。”

值得注意的是,研究团队还发现某些宿主蛋白在病毒感染过程中被病毒“重新编程”,其功能从抗病毒转变为促病毒。例如,宿主蛋白DDX21原本参与抗病毒免疫应答,但在流感病毒感染后,被NS1蛋白招募到复制工厂中,反而促进了病毒RNA的合成。这种“功能逆转”现象为理解病毒如何操纵宿主细胞提供了全新视角。

临床意义与未来方向

该研究的临床意义在于,病毒复制复合体中的多个宿主蛋白在进化上高度保守,不易发生突变,因此针对这些宿主蛋白的抗病毒药物可能比直接靶向病毒蛋白的药物更不易产生耐药性。研究团队已经利用该分子地图筛选出几种小分子化合物,能够有效阻断NS1蛋白与宿主蛋白的相互作用,在细胞实验中显示出显著的抗病毒活性。

“我们正在与制药公司合作,优化这些先导化合物的药代动力学特性,”Müller博士补充道,“如果一切顺利,有望在3-5年内进入临床试验阶段。”此外,该分子地图还可用于预测新型流感病毒株的致病性,为公共卫生防控提供预警。


Journal Reference: Anna K. H. Müller et al. A molecular map of influenza virus replication factories in human cells. Nature, 2026. 
(责任编辑:泉水)