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相同的朊病毒颗粒在活体中可能产生不同的表型或“株系”。这一矛盾通常用朊病毒构象差异来解释。Tanaka等人提出了一个分析模型，描述了酵母中朊病毒的不同物理参数与颗粒之间的相互作用如何导致特定类型朊病毒的出现。他们的实验表明，最强的表型实际上是由生长缓慢但脆性增加（脆性增加促进颗粒分裂）的颗粒产生的。朊病毒颗粒分裂并为进一步生长生成新“种子”的趋势，在感染性（朊病毒）和非感染性淀粉样蛋白对其宿主的重大生理影响中可能是一个关键因素。