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华裔科研人员郑宁助理教授在最新一期的《自然》杂志上发表了一篇关于泛素蛋白连接酶结构生物学的新文章。该研究揭示了DDB1-CUL4-ROC1 E3复合体的装配和功能机制，阐释了cullin-RING E3复合体的结构基础。

蛋白质泛素化是后翻译修饰的一种常见形式，通过一个三酶级联（E1-E2-E3）过程调节不同细胞途径中的蛋白质底物。cullin-RING复合体超级家族是这一过程中的关键酶。DDB1-CUL4-ROC1复合体是一种最近确定的cullin-RING泛素连接酶，它在DNA修复、DNA复制和转录调控中发挥重要作用。

研究人员通过对人类DDB1-CUL4A-ROC1复合体的晶体结构分析，发现DDB1利用一个β-propeller结构域与cullin骨架结合，并通过一个多变的双β-propeller折叠进行底物呈递。此外，通过质谱分析，研究人员鉴定出了一类新的WD40-repeat蛋白家族，这些蛋白直接与DDB1的双propeller折叠结合，充当E3酶的底物募集模块。

这些结构和蛋白质组学研究结果揭示了cullin-RING E3复合体装配和功能的多样性背后的结构机制和分子逻辑。