专家解析结合RNAi与测序技术研究癌症
时间:2011-03-03 19:31 来源:生物通 作者: 点击:次
| 随着新代测序方法的迅猛发展，越来越的科学家开始利用一方便快捷的技术进行深层次研究工作，并陆续获得了许多重要的成果
来自美国国家卫生研究所下属美国国立研究所的Louis M. Staudt教授是一位从事癌症研究多年的科学家，其研究组曾发现了6能预测淋巴瘤生存期的基因，还弄清楚了骨髓瘤中到底是什么控制骨髓瘤细胞的活性和扩散。这些研究对于癌症的治疗与预防具有重要意义。 之的研究通过分析人类淋巴瘤免疫球蛋白基因以及基因工程小鼠模型，了解了B细胞抗原受体（BCR）信号在淋巴瘤形成过程中的作用，但是科学家们还没有找到这一受体如何导致人类淋巴瘤形成的与功能性证据。 在这篇文章中，研究人员发现了一种“慢运动”BCR信号，这种信号对于维持弥漫B细胞淋巴瘤(DLBCL)ABC亚型中细胞的存活具有重要作用。研究人员认这种“慢运动”BCR信号是ABC型弥漫大B细胞淋巴瘤的一种新发病机制，因此可以作为治疗这一疾病的一种新策略和靶标。 弥漫大B细胞淋巴瘤是成人非霍奇淋巴瘤中最常见的一种类型，大约占30-40%，多见于中老年人，中国40-50岁居多。在欧美国家，DLBCL 的发病率约占非霍奇金淋巴瘤(NHL)的 31%。中央电视台著名播音员罗京就是因为这一疾病而离世的。 在这一研究工作中，研究人员不仅采用了RNAi干扰技术，还通过Illumina的GAII测序仪进行分析，这两种方法的结合有助于研究工作的顺利进行。 Illumina的GAII测序技术能够在单核苷酸水平对任意物种的整体转录活动进行检测，在分析转录本的结构和表达水平的同时，还能发现未知转录本和稀有转录本，精确地识别可变剪切位点以及cSNP（编码序列单核苷酸多态性），提供全面的转录组信息。并且这一方法相对于传统的芯片杂交平台，RNA测序无需预先针对已知序列设计探针，即可对任意物种的整体转录活动进行检测，提供精确的字化信号，更高的检测通量以及更广泛的检测范围。 (责任编辑：glia) |
- 上一篇：2010，高通量测序技术日渐成熟
- 下一篇：Nature：单细胞测序技术研究癌变肿瘤