来自德国马克斯·普朗克生物物理化学研究所（Max Planck Institute for Biophysical Chemistry）、耶鲁大学医学院、瑞士巴塞尔大学以及日本冈山大学医学院等机构的研究人员，以突触囊泡（synaptic vesicle）为模型，提出了一种研究细胞内整体运输器（trafficking organelles）的新方法，为理解细胞物质运输机制提供了重要信息。该研究成果于2006年11月17日作为《细胞》（Cell）杂志封面文章发表。

囊泡运输是真核细胞膜运输的关键过程，涉及从供体室（donor compartment）出芽形成囊泡，随后融合到受体室（acceptor compartment）中。神经递质正是以囊泡形式通过胞吐作用释放。尽管出芽和融合的一般规律已较为清楚，许多参与蛋白也被发现，但运输器的整体详细描述此前一直未能确定。

在这项研究中，Shigeo Takamori等人以突触囊泡为例，系统测定了其蛋白质和脂质的组成，描述了囊泡的大小、密度和聚集状态，计算了每个囊泡的平均蛋白质和脂质质量，并明确了主要组分的拷贝数。他们整合所有数据构建了一个囊泡模型，发现突触囊泡主要由蛋白质组成，其中运输蛋白种类异常丰富。值得注意的是，囊泡质子-ATP酶（vacuolar-type H⁺-ATPase, V-ATPase）仅存在一两个拷贝，而膜运输和神经递质释放所必需的其他蛋白则具有多个拷贝。

该研究将定量生物化学与生物物理学方法相结合，揭示了大鼠大脑突触囊泡的蛋白质和脂质组成，为在分子水平上研究囊泡提供了一种定量方法。这一成果不仅加深了对神经递质释放机制的理解，也为研究其他细胞器（如溶酶体、内体）的组成和功能提供了可借鉴的定量策略。

自2006年以来，随着冷冻电镜（cryo-EM）和单分子荧光技术的进步，对突触囊泡循环（synaptic vesicle cycle）的认知已大幅扩展。近年来研究进一步阐明了SNARE蛋白复合体在囊泡融合中的核心作用，以及囊泡内吞（endocytosis）和再循环的分子机制。Takamori等人建立的定量框架至今仍是该领域的重要参考，并持续启发着对神经递质释放调控的深入探索。