据美国农业部发布的参赞报告显示，欧盟是全球最大的生物柴油生产区，生物柴油占欧盟生物燃料总产量的约80%。约80%的生物柴油由油菜籽生产，其余主要由葵花油和豆油生产。生物柴油市场份额庞大的主要原因是欧盟相当一部分汽车由柴油驱动，且柴油供应短缺。

生物柴油行业自2000年以来每年增长约28.2%，发展迅速。2005年，欧盟有20个成员国生产生物柴油，而2004年仅为11个。2005年产量为290万吨，较2004年的190万吨增长65%。主要生产国为德国、法国和意大利。然而，欧盟油菜籽产量可能无法满足生物柴油生产需求，油籽和植物油进口将变得重要。

2007年，欧盟生物柴油产量预计从2005年的290万吨增至610万吨，其中德国增幅最大。2005年德国产量为166万吨，预计2007年达300万吨。德国取消生物柴油矿物油税是行业快速发展的主因，但随着税收政策调整，未来产量增幅将趋稳。自2006年8月起，德国对纯生物柴油征收9欧分/升的能源税，其中4-5欧分由消费者承担，其余由生产商和加油站支付。此外，原油和柴油价格下跌对生物柴油构成竞争，生产商更愿使用进口菜籽油（比国产便宜30欧元/吨）。

在捷克，政府通过减免税金支持生物柴油生产，生产商在证明油籽甲酯用于生物柴油后可从农业部获得补贴。但捷克生产商更愿向德国出口油菜籽甲酯，因售价更高。明年情况可能改变，届时政府将强制规定生物柴油掺混率达5%，并提高售价。捷克部长指出，欧盟正取消支持（除德国），消费者需额外付费支持生产商。

2006年8月，波兰通过生物燃料法及相关法规，指定专门部门监督生物柴油生产和使用，法规于2007年1月1日生效。波兰专家认为，波兰能在2010年实现欧盟规定的5.75%生物柴油掺混目标。