磁共振检查时，被检查者需要处在一个强大的外加磁场中，因而任何顺磁物质(主要是指金属制品)都容易被磁化，影响成像。故检查前应该仔细查看身上是否携带钥匙、发卡、金属钮扣、手表、金属义齿和首饰等。另外磁场还能使仪器停止工作，故装有起搏器、金属呼吸器的患者禁忌做磁共振检查。

    一般磁共振成像时间长，做头部检查约需40分钟才能完成，而且在检查中还必须保持某一固定姿势，这对某些有不自主多动或病情危重的急症患者来说，是难以接受的。

    磁共振的长处是对含水分(氢)多的组织结构显示较好，但对组织钙化及骨路病变的显示效果要差些，故如果考虑头痛与骨组织有关时，应首先选择做头颅片或脑CT检查，而不首选磁共振。此外，磁共振检查费用昂贵(约为CT的3～4倍)，因此，初步检查应选其他经济、简便的方法，最好要听取专科医师的意见。