1 项目资助背景
2010年5月底,欧盟系统生物学研究协会()于巴黎资助了16个国际合作新项目,旨在解决诸如食品安全、健康老龄化以及癌症、结核病和肝炎等全球性问题。项目参与者涉及遍布欧洲的各个国家的科研组织机构。16个项目中的12个是由英国生物技术和生物科学研究理事会(Biotechnology and Biological Sciences Research Council,BBSRC)资助的,其中每个项目至少有一个英国组织参与,BBSRC共投资770万欧元。此次16个项目立项总投资2 400万欧元。
此次投资的16个项目由国际研究项目51个备选方案中选出,涵盖了生命科学领域不用研究方向,全部采用系统生物学的方法来解决当前一系列全球问题,即用整体系统的方法对每一个生物体系进行观察并建立研究模型。全部项目由来自14个国家的85个研究小组完成,其中BBSRC资助的12个项目由18个英国科研小组负责。
2 资助项目介绍
2.1食品安全研究项目
食品安全研究项目包括:牛津大学(University of Oxford)和牛津布鲁克斯大学(Oxford Brookes University)负责的水果综合建模(FRuit Integrative Modelling,FRIM)项目;卡第夫大学(Cardiff University)负责的芽茎尖分生组织系统的综合分析(Integrative Systems Analysis of the Shoot Apical Meristem,iSAM)项目。
2.2
健康老龄化研究项目包括:伯明翰大学(University of Birmingham)负责的LINCONET项目,旨在构建人类间充质干细胞系的基因调控网络模型,以期寻找靶向退行性代谢紊乱症的药物。
曼彻斯特大学(University of Manchester)负责的SYNERGY项目,以核受体基因调控生物学为研究重点。
南安普敦大学(University of Southampton)和爱丁堡大学(University of Edinburgh)负责的SynProt项目,用系统生物学方法,阐明负责突触可塑性和记忆性蛋白质的局部翻译编码。
利物浦大学(University of Liverpool)英国医学研究委员会剑桥分子生物学实验室(MRC Laboratory of Molecular Biology, Cambridge)负责的GRAPPLE项目用线虫(C. elegans)来建立压力、疾病、老化生理现象中基因调控模型。
2.3癌症等疾病研究项目
英国医学研究委员会伦敦国立医学研究院(MRC National Institute for Medical Research)负责的LymphoSys项目主要研究Th17细胞分化的信号通路和基因调控网络。
伦敦大学皇家霍洛威学院(Royal Holloway University of London)和圣乔治学院(St George's University of London)负责的SHIPREC将比较与“不速之客”共生的植物和动物对内吞侵入的反应。
牛津大学(University of Oxford)的EpiGenSys项目主要研究系统生物学研究表基因组学中的构效关系。
伦敦大学学院(UCL)华威系统生物学(Warwick Systems Biology)负责的C5Sys项目主要研究肿瘤中的周期生长和细胞周期时钟体系。
帝国理工学院(Imperial College London)负责的ApoNET项目将系统分析肝细胞的TNF 和TRAIL信号通路。
曼彻斯特曼彻斯特交叉学科生物中心(Manchester Interdisciplinary Biocentre)负责的livSYSiPS项目主要采用系统生物学方法,整合分析体外培养人源多功能诱导干细胞分化的肝脏细胞的数据。
萨里大学(University of Surrey)负责的TB-HOST-NET项目将研究MTB杆菌MTB bacillus和被感染的人树突细胞和巨噬细胞转录和必要基因表达谱,构建计算机整合模型,以期阐明宿主—病原体相互作用的分子交互网络。
另外,BioModUE_PTL项目将构建子宫肌电图生物物理模型,用来了解和预防早产;Zebrain项目将研究斑马鱼大量神经元群的行为动力学,阐明生物如何做出决定的这一过程;ModHeart项目用果蝇Drosophila melanogaster建立基因如何调控胎心发育的组织模型。
3 相关评论
BBSRC行政总裁Douglas Kell教授认为,系统生物学是一种强有力的多功能工具, ERASysBio+资助的一系列项目不仅综合多学科的知识,还组织不同国家共同研究,这种用合作的方式攻克科技难题变得日益重要起来。除了充分利用本国的生物科学知识、技术和仪器设备,还要和其他国家大学共享这些资源,同样,这种合作也要运用到如数学、计算机学、化学和物理学等其它领域。
(张永娟 整理)