荧光原位杂交(Fluorescence In Situ Hybridization, FISH)是一种利用荧光标记的核酸探针与染色体或细胞核中的特定DNA序列进行杂交,从而在显微镜下直接观察目标序列位置和数量的分子细胞遗传学技术。该技术广泛应用于基因定位、染色体畸变检测、肿瘤诊断和基因组研究等领域。
FISH技术的基本原理是:将荧光素直接或间接标记的DNA探针与变性后的染色体或间期核DNA在适宜条件下退火杂交,通过荧光显微镜检测杂交信号,从而确定目标序列在染色体上的具体位置。与传统的放射性同位素标记原位杂交相比,FISH具有安全性高、实验周期短、分辨率高、可多色标记等优点。
FISH技术的主要操作步骤包括:
1. 染色体或间期核玻片标本制备:将细胞悬液滴于洁净载玻片上,室温老化4-7天后用于杂交。
2. 探针制备与标记:探针DNA可来源于质粒、BAC、YAC等载体,长度最好大于10 kb。标记方法包括缺口平移法和随机引物法,标记物可为生物素、地高辛(间接标记)或荧光素(直接标记)。直接标记法操作简便,但信号不可放大;间接标记法可通过免疫荧光放大信号,适用于小片段或低拷贝序列的检测。
3. 玻片与探针变性:玻片在70%甲酰胺/2×SSC中70℃变性2分钟,梯度乙醇脱水干燥;探针在75℃水浴变性7分钟,立即冰浴3分钟,37℃预杂交1-2小时。
4. 原位杂交:将变性后的探针加于玻片标本上,封片后37℃杂交过夜。
5. 洗片:依次用50%甲酰胺/2×SSC、2×SSC、0.1×SSC和4×SSC/0.1% Tween在45℃下洗涤,去除未结合探针。
6. 免疫荧光显色(间接标记):加荧光抗体(如抗生物素-FITC)37℃孵育30分钟,洗涤后DAPI复染细胞核。
7. 荧光显微镜观察与图像采集:使用相应滤光片观察杂交信号,并采集图像进行分析。
FISH技术的分辨率可达1 kb左右,空间分辨率优于放射性原位杂交。然而,该技术也存在局限性,如探针设计复杂、非特异性杂交、信号强度受探针大小和标记效率影响等。近年来,随着探针标记方法和显微镜技术的进步,FISH已发展成为基因组学和临床诊断中不可或缺的工具。