原位杂交组织化学技术是分子生物学与组织化学结合的重要方法,用于在组织或细胞中定位特定核酸序列。本文系统整理了该技术中常用试剂的配制、用途及注意事项,涵盖固定液、培养基、质粒提取液、杂交前处理液、杂交液、漂洗液及信号显示液等。
一、固定液
1. 4%多聚甲醛:适用于组织及细胞固定,也可用于新鲜冰冻切片后固定。常用0.1mol/L PBS(pH7.4)配制,4℃保存。
2. 10%福尔马林:较适于固定细胞。市售甲醛与PBS按比例混合。
3. 10%中性福尔马林:配方:市售甲醛100ml,Na2HPO4 4g,NaH2PO4 6.5g,DEPC水补至1000ml。常用于石蜡切片固定。注意:10%甲醛可促进DNA交联,干扰DNA变性,故不适于DNA杂交;但可通过含50%甲酰胺的杂交液使DNA解链解决。
4. 4%戊二醛:效果较40%差,但0.1%戊二醛常用于固定组织,适于新鲜组织冰冻切片及石蜡切片后固定,常用于DNA原位杂交。
5. 乙醇/醋酸(3:1):将乙醇与冰醋酸按3:1混合。适于固定细胞的原位杂交,尤其检测DNA时。RNA保留较差,但背景低。
6. 甲醇/醋酸(3:1):临用前混合。
7. 甲醇/丙酮(1:1):适于培养细胞的原位杂交。
8. 4%多聚甲醛-0.5%~1%戊二醛:在pH7.4磷酸缓冲液中,用于免疫电镜样品固定。
二、LB培养基
1. 液体LB培养基:称取胰蛋白胨10g,酵母提取物5g,NaCl 10g,加水约800ml溶解,用5N NaOH调pH至7.0,定容至1000ml,15磅高压灭菌20min。
2. 琼脂糖平板培养基:在液体LB中加入15g琼脂,高压灭菌后倒平板。
三、小量质粒提取主要液体
1. 溶液Ⅰ:50mmol/L葡萄糖,25mmol/L Tris-HCl(pH8.0),10mmol/L EDTA(pH8.0)。
2. 溶液Ⅱ:0.2N NaOH,1% SDS(临用前配制)。
3. 溶液Ⅲ:3mol/L醋酸钠(pH4.8):称取醋酸钠·3H2O 81.6g,加水溶解,用冰醋酸调pH至4.8,定容至200ml。
四、杂交前处理液
1. 蛋白酶K:储备液(1mg/ml)用0.1mol/L Tris-HCl(pH8.0)、50mmol/L EDTA配制,-20℃保存。工作液(0.025mg/ml)临用前稀释。用于消化组织,提高探针穿透性。过度消化会破坏形态和核酸。
2. 甘氨酸:1mol/L储备液(75g/L),工作液0.1mol/L(1:10稀释)。用于终止蛋白酶K作用。
3. 0.25%醋酸-0.25%醋酸酐:配方:NaCl 5g,三乙醇胺 13.3ml,浓HCl 4ml,DEPC水补至997.5ml,临用前加醋酸酐2.5ml。乙酰化处理可减少探针非特异吸附,降低背景。
4. RNA酶溶液:RNA酶A溶于DEPC水(10mg/ml),-20℃保存。工作液用2×SSC稀释至0.01mg/ml。
5. 0.2% Triton X-100:2ml Triton X-100加入998ml PBS中。
五、杂交用液
1. SSC:20×SSC:NaCl 175.3g,柠檬酸钠 88.2g,加水800ml,用10N NaOH调pH至7.0,定容至1000ml,加DEPC至0.1%,高压灭菌。用于配制预杂交液和洗脱液。
2. Denhardt's液:50×:聚蔗糖(Ficoll)5g,聚乙烯吡咯烷酮(PVP)5g,牛血清白蛋白(BSA)5g,加水定容至500ml,过滤,-20℃保存。
3. 杂交液:含50%去离子甲酰胺,5×SSC,5×Denhardt's,0.5% SDS,100μg/ml鲑精DNA(变性),10%硫酸葡聚糖。硫酸葡聚糖需50℃促溶。探针浓度:RNA 0.5~2μg/ml,DNA 1μg/ml。35S标记探针需加100mmol/L DTT。
六、杂交后漂洗溶液
常用2×SSC/0.1% SDS(高离子强度)和0.1×SSC/0.1% SDS(低离子强度)依次洗脱。RNA探针杂交后需用RNA酶处理(10μg/ml RNase A in 2×SSC)去除未结合探针。Dig标记探针使用缓冲液1(0.1mol/L Tris-HCl, 0.15mol/L NaCl, pH7.5)和缓冲液2(含1% blocking reagent),显色前用缓冲液3(0.1mol/L Tris-HCl, 0.1mol/L NaCl, 50mmol/L MgCl2, pH9.5)平衡。
七、信号显示
1. A-B显影液:用于免疫金银法,A液(0.22mol/L柠檬酸,0.17mol/L柠檬酸钠,0.5mol/L对苯二酚)与B液(0.07mol/L硝酸银)临用前1:1混合,室温避光显影5~15min。
2. DAB-H2O2显色液:用于HRP标记,产物棕黄色。
3. NBT-BCIP显色液:用于碱性磷酸酶标记,产物紫蓝色。
4. Kodak D-19显影液:用于放射自显影,配方:水500ml(50℃),米吐尔2g,无水亚硫酸钠90g,对苯二酚8g,无水碳酸钠52.5g,溴化钾5g,加水至1000ml。
5. Kodak F-5定影液:配方:水600ml(50℃),硫代硫酸钠240g,无水亚硫酸钠15g,28%醋酸48ml,硼酸7.5g,钾矾15g,加水至1000ml。