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原位杂交组织化学常用试剂及处理

时间:2010-09-13 09:37来源: 作者:

NA的组织及细胞固定,也可用于新鲜冰片切片后固定。

  ②10%福尔马林试剂:

  较适于固定细胞。

  ③10%中性福尔马林

  市售甲醛           100ml

  Na2HPO4                4g

  NaH2PO4               6.5g

  DEPC水           ~1000ml

  常用于石蜡样品切片的固定。

  10%的甲醛由于有促进DNA双链分子交联的作用,干扰DNA变性,故不适于DNA杂交。在组织或细胞原位杂交中,可通过使用含50%甲酰胺的杂交液使DNA变性解链而解决。这类固定液在DNA/RNA杂交中有较好的效果。

  3.4%戊二醛效果较40%差。

  4.0.1%戊二醛常用于固定组织,适于新鲜组织冰冻切片及石蜡切片的后固定,常用于检测DNA的原位组织杂交方法。

  5.乙醇/醋酸(或冰醋酸)将乙醇与醋酸按3:1的体积比充分混合即可。该液较适于固定细胞的原位杂交,尤其检测DNA时。

  乙醇/醋酸虽广泛应用于原位杂交中,但RNA保留较差,可本底很低,即背景染色淡。

  6.甲醇/醋酸(3:1)用前按体积比3:1比例充分混合即可。

  7.甲醇/丙酮(1:1)适于培养细胞的原位杂交技术。

  8.4%多聚甲醇-0.5%~1%戊二醛溶液在pH7.4磷酸缓冲液中,用于免疫电镜样品固定。

  四、LB培养基

  (一)液体LB培养基(Luria-Bertani培养基)

  配制:取一1000ml的烧杯,将事先称取好的试剂加入杯内,加H2O约500~800ml搅拌使其溶解完全。用5N的NaOH调pH至7.0,加入H2O定容至1000ml。15磅高压灭20min。

  (二)琼脂糖平板培养基 

  细菌培养用琼脂(或琼脂糖)    15g

  液体培养基(如LB)        ~1000ml

  按浓度比例,将琼脂加入液体培养基(如LB)中,稍加搅拌,用纱布或纸封好瓶口,15磅高压灭菌20min。

  五、小量质粒提取主要液体

  1.溶液Ⅰ

  2.溶液Ⅱ

  3.溶液Ⅲ(3mol/L醋酸钠)

  加热溶解后,再用冰醋酸(约40ml)调pH至4.8,补足H2O至200ml。

  六、杂交前处理

  1.蛋白酶(Proteinawe K, Pro.K) 蛋白酶K主要用于杂交前标本处理,其作用是使组织达到一定消化,利于检测分子的穿透,从而提高检测方法的敏感性,但各种组织在不同条件下消化程度不一,因此,具体应用时,应根据组织种类、温度确定反应时间及酶的浓度。过度消化可使组织形态结构遭到明显破坏,核酸分子也会受到影响。通常是将其配成储备液(1mg/ml),临用前,再配成工作液(约0.025mg/ml)。配制方法:

  精心称药,将二者充分混合后,分装成小份,-20℃存放,用时再取出冻融,余者弃去。

  (2)工作液(临用前配):

  取储备液(1mg/ml)按1:40稀释,充分混合,即得约含Pro.K为25mg/ml的工作液。

  (3)关于P-K缓冲液的配制:

  称取上述试剂,充分混合即可。

  ②1mol/L 的Tris-HCl(pH8.0):

  先将Tris于800ml ddH2O中溶解,用HCl将pH调至8.0,ddH2O定溶于1000ml,高压灭菌,室温备用即可。

  ③0.5mol/L的EDTA:

  称取EDTA溶于约600ml ddH2O中,常需60℃持续搅拌以助溶,滴加NaOH至pH接近8.0时,EDTA才开始溶解。待完全溶解后,冷却至室温,NaOH调pH至8.0,ddH2O定溶至1000ml,高压灭菌,室温备用。

  2.甘氨酸

  (1)1mol/L甘氨酸:

  称取甘氨酸75g溶于ddH2O或DEPC水中,最后补足ddH2O定容至1000ml,高压灭菌备用。该液为储备液,-20℃储存。

  (2)甘氨酸工作液(0.1mol/L):

  将二者按1:10比例稀释,即得甘氨酸工作液。一般要求临用前新鲜配制。

  甘氨酸有终止蛋白酶K作用的作用,以防过度消化。

  3.0.25%醋酸-0.25%醋酸酐

  配制:按上述配方,先以少许DEPC水溶解NaCl,然后加入三乙醇胺及浓HCl。DEPC水定容至约1000ml(997.5ml),临用前,一边摇动溶液一边加入醋酸酐,充分混合。注意操作时避免浓HCl 溅出,最好在通风条件下进行。

  生物体内有些组织,如神经组织中的蛋白质,对带负电荷的核酸探针较易吸附。经该液乙酰化处理后,可使切片标本表现带上负电荷,有排斥带负电的核酸探针,减少非特异吸附,降低反应背景的作用。

  4.RNA酶溶液

  取RNA酶A溶解于100ml DEPC水中,分装成小份(1ml,10mg/ml),-20℃储存。

  临用前,取RNA酶A储备液,用2×SSC溶解配成工作液(0.01mg/ml).

  5.0.2%

  取2ml Triton X-100加入998ml PBS中,充分振荡使其充分混合。

  七、杂交用液

  1.SSC(Standard Saline Citrate, SSC)

  通常配成10×,20×,50×的储备液,如下:

  配制:先称取上述两种试剂,溶于约800ml ddH2O中,滴加10N的NaOH,将pH值调至7.0,补足ddH2O至1000ml,加入终浓度为0.1%~0.2%的DEPC,分装后高压灭菌,可室温保存。

  该液主要用于配制予杂交液及杂交后的各种洗脱液,以保持一定的离子强度。此外,在用于杂交的湿盒内也常用5×的SSC以保持一定湿度。

  2.Denhardt’s液

  通常配成10×,50×或100×的储备液

  配制:称取上述试剂,溶于800ml左右灭菌ddH2O中,定容至1000ml后,过滤后于-20℃保存备用。

  该液用于配制杂交液及予杂交液等。

  3.杂交液及予杂交液

  ※:临用前加;△予杂交液不加

  配制:先以去离子甲酰胺与SSC于室温混合,加入硫酸葡聚糖于50℃促溶,依次加入其它成份。硫酸葡聚糖在室温常需数小时才能完全溶解。有时需旋涡振荡。定容后充分混合。根据使用方便可分装(最好用铝箔将瓶子包好)存于4℃,可达数月。注意,杂交缓冲液在使用前切忌污染。

  变性被打断的无关DNA(常为鲑精DNA或鲱精DNA)可在予杂交及杂交前加入。此外,有许多物质如肝素、多聚腺甘酸、醋酸钠等多种成份,可根据需要加入杂交液中,上述配方所列只是不可缺少的基本成份。

  配制好的杂交液不宜反复冻融,否则易产生硫酸葡聚糖沉淀现象。使用前最好加热至50℃,使其充分溶解后再加入探针分子。至于探针的浓度视实验目的、探针类型及标记方法而异。通常RNA探针分子浓度为0.5~2μg/ml,DNA探针浓度为1μg/ml,此外,如使用35S标记的探针,还需加入终浓度为100mmol/L的二硫苏糖醇(Dithiothreitol,DTT)至杂交液及杂交后的洗脱液中。

  八、杂交后漂洗溶液

  无论用何种标记方法及何种信号显示方法,在杂交后洗脱则是大同小异。在此,归纳几种带有共同性及常用的洗脱液。

  该液常用于杂交后的初次洗脱,故离子强度(张力)较高。

  该液常用于杂交后的第二次洗脱,离子强度较低,经过上述两套洗脱液洗后,有的还可用2×SSC,10%(0.1%)SDS洗脱。

  

  主要是洗去残留的RNA,降低背景。用于以RNA为探针的原位杂交方法中。

  4.Dig标记探针杂交后处理液

  用ddH2O溶液并定容至1000ml。

  用ddH2O溶解并定容至1000ml。

  配制同上。

  左旋咪唑有消除内源性磷酸酶的作用。

  九、原位杂交信号显示

  目前应用原位杂交方法中,信号的显示主要有放射自显影,酶底物及免疫金银等方法,在此归纳有关的主要试剂。

  1.A-B显影液

  称取上述试剂,按配方分别溶于50ml ddH2O中,于显影前,在室温将两者(A液及B液)按1:1混合,稍加摇动促进混合,即可将贴有切片标本的切片放入显影液,于室温避光(可暗室)反应5~15min。显影时间和温度相关,需自己根据情况摸索。终止反应只需将显影液倒出,自来水冲洗即可。倒出的AB显影液可暂时不扔,光镜下观察,若明显显影不够,还可重新或继续显影。AB显影液要求临用前配制,在显影时才将AB二液混合。否则,A液过久会产生黄色沉淀,增加背景。

  AB液用于免疫金银法中,使金标记颗粒信号放大,形成棕黑色沉淀。

  2.DAB-H2O显色液

  配制方法见附录一。

  该液用于标本被标记上辣根过氧化物酶(HRP)的方法。产物为棕黄色。

  3.NBT-BCIP显色液

  配制方法,详见附录一。

  该液用于有碱性磷酸酶标记物的方法中。产物为紫蓝色。

  4.Kodak D-19显影液

  配制:先将500ml水中加温50℃,按上述配方顺序加药,同时充分搅拌,每加一种药完全溶解后,再加另一种药品,否则,所配的显影液易产生混浊而效果差,最后补足水至1000ml充分混合,室温或4℃避光保存。最好包上纸。

  该液用于放射自显影时的显影。

  5.Kodak F-5定影液(酸性坚膜定影液)

  ※:28%醋酸为3份冰醋酸和8份水混合液。

  配制:同Kodak D-19显影液。 (责任编辑:glia)

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