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用云计算攻克癌症:高性能计算在肿瘤研究中的应用与挑战

2010-11-09 21:37 Jack R. Collins 全国高性能计算年会(HPC China 2010) 阅读 0
核心摘要: 本文介绍了2010年全国高性能计算年会上Jack R. Collins博士关于利用高性能计算和云计算攻克癌症的演讲。文章阐述了癌症研究的计算需求、数据爆炸式增长带来的四大挑战,以及云计算作为解决方案的潜力,旨在推动医学研究中的计算互通性和数据共享。

在2010年全国高性能计算年会(HPC China 2010)上,美国高级生物医学计算中心(Advanced Biomedical Computing Center)的Jack R. Collins博士发表了关于如何利用高性能计算(HPC)和云计算攻克癌症的演讲。他指出,癌症已成为全球主要的健康威胁,2009年美国每56秒就有一人因癌症去世,2010年新确诊的癌症患者超过160万。癌症研究涉及药物研发、致癌机理和基因组学等多个方向,这些领域都需要大量的计算模拟支持。美国国家癌症研究所(NCI)的研究数据规模随着癌症研究的深入和数学模型的精确化而爆炸式增长,这给高性能计算带来了四大挑战:数据海量增长、计算性能压力、软件与系统长远规划,以及社会对可靠性和安全性的质疑。

数据大规模增长会为存储后台、网络带宽以及自动化和安全性带来问题;计算规模增加则对程序并行度、I/O环境和编程复杂度造成巨大阻碍;长远规划需要解决平台系统搭建、HPC编程和人员培训问题;虚拟化稳定性、数据安全和存储环境的需求也需要共同答案。Jack博士认为,未来云计算有望解决这些难题,将HPC转化为计算即服务(CaaS)和信息即服务(IaaS),从而促进医学研究中的计算互通性和数据共享。

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