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学术索引

版纳植物园成功研发比较基因组程序包,突破高通量测序分析瓶颈

中国科学院西双版纳热带植物园研究员Chuck Cannon与北京基因组研究所及美国得州理工大学合作,研发出可直接分析高通量短序列数据的程序包,突破传统组装瓶颈,简化比较基因组和转录组研究。该程序包通过检测kmer片段的存在与频次,无需参考基因组即可分析序列差异,并利用174个叶绿体全基因组数据验证其功能。研究成果发表于《科学公共图书馆—综合》,获中科院和云南省项目资助。...

2012-12-11 202 0

版纳植物园等自主开发叶绿体全基因组比较基因组程序包

中科院西双版纳热带植物园等机构自主开发了叶绿体全基因组比较基因组程序包,该程序包无需事先组装基因组,通过直接分析kmer片段实现高通量短序列数据的比较基因组和转录组研究,突破了非模式生物基因组分析瓶颈。研究基于174个叶绿体全基因组数据验证了程序包功能,相关成果发表于PLOS ONE。...

2012-11-30 216 0
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