基于新兴测序技术与深度学习的环状RNA发现与功能解析进展
本文综述了环状RNA(circRNA)研究中基于新兴测序技术和深度学习算法的最新进展,重点介绍了短读长与长读长测序技术的检测策略、单细胞及空间转录组分析方法,以及深度学习在circRNA识别中的应用,展望了人工智能驱动的未来发展方向。...
本文综述了环状RNA(circRNA)研究中基于新兴测序技术和深度学习算法的最新进展,重点介绍了短读长与长读长测序技术的检测策略、单细胞及空间转录组分析方法,以及深度学习在circRNA识别中的应用,展望了人工智能驱动的未来发展方向。...
长读长全基因组测序(LR-WGS)作为一项突破性技术,正逐步从研究工具迈向临床诊断,有望显著提升罕见病的诊断率。2025年5月7日,卡罗林斯卡学院的研究人员在《自然-遗传学》上发表前瞻性文章,系统阐述了LR-WGS整合到常规临床诊断中的关键挑战与潜在收益。文章详细比较了短读长测序的局限性,如无法检测复杂结构变异、重复扩增和DNA甲基化,并介绍了长读长测序在检测这些变异方面的独特优势。同时,文章提出了分阶段的临床实施策略,包括标准化、成本控制、数据分析等挑战的解决方案,为临床基因组学界指明了通向临床应用的标...
费城儿童医院研究团队开发的新型RNA测序平台STRIPE,能够对全长RNA分子进行深度测序,为罕见病患者的分子诊断提供新途径。该技术突破了传统DNA测序仅20%-50%诊断率的局限,通过直接观察RNA加工异常,在标准检测阴性的患者中新发现5例诊断。STRIPE成本约100美元/样本,适用于临床易获取的皮肤成纤维细胞和血液样本,有望成为基于RNA的精准医学基础。...
本文系统分析了微生物群落中抗生素耐药基因(ARG)分析的技术与生物学挑战,包括短读长测序难以确定ARG宿主和遗传背景、公共数据库偏差、以及从ARG丰度推断健康风险的局限性。同时讨论了长读长测序、Hi-C、功能宏基因组学和深度学习等新兴方法带来的机遇。文章强调,ARG丰度增加可能源于群落组成变化而非抗性选择,需谨慎解读。...
《自然-通讯》发表了一项重磅研究,利用长读长测序技术绘制了人类基因组串联重复序列的全景图谱。该图谱包含数百万个TR位点,揭示了其在基因表达调控中的关键作用,并发现特定TR扩增与神经退行性疾病及发育障碍的强关联,为临床遗传学诊断提供了重要数据支持。...
本文介绍了一项最新研究,表明长读长测序技术能够有效诊断由结构变异引起的罕见病。斯坦福大学的研究人员使用Pacific Biosciences的Sequel测序仪,成功发现了一名卡尼综合征患者中短读长测序未能检测到的PRKAR1A基因杂合缺失。该研究强调了长读长测序在提高临床诊断率方面的潜力,同时讨论了其成本效益和适用场景。...
冷泉港实验室等机构利用Oxford Nanopore长读长测序技术,对牙买加果蝠和中美须蝠进行全基因组测序,发现蝙蝠在DNA修复和癌症相关基因上表现出显著适应性进化,癌症相关基因富集程度是其他哺乳动物的两倍以上。研究揭示了蝙蝠抗癌与抗病毒能力的基因组基础,为人类癌症和感染性疾病研究提供了新线索。...
密歇根大学研究团队在小鼠中发现一条意想不到...
芬兰研究团队在《科学》杂志上发表了一项突破...
一项开创性研究利用人工智能(AI)分析常规视网...
一项发表于《eLife》的新研究揭示了山雀(一种社...
胰腺导管腺癌(PDAC)是最常见且最难治的胰腺癌...
AI智能编码框架正以前所未有的速度重塑理论神经...