2012年9月25日，一项发表在《儿科学》（Pediatrics）上的新研究证实，儿童使用某些抗生素可能增加患肠道疾病的风险。研究人员发现，早期儿童服用抗生素越多，后来发展为克罗恩病和溃疡性结肠炎等炎症性肠病（IBD）的风险越高。

西雅图华盛顿大学医学院儿科感染性疾病助理教授Matt Kronman博士指出，两者之间存在剂量-反应关系：儿童使用抗生素越多，罹患肠道疾病的风险也越高。此前已有研究提示抗生素使用与肠道疾病相关，但这些研究存在局限性。

该研究分析了100万名17岁及以下儿童以及近500名健康儿童的数据，并在1994年至2009年间进行了至少两年的随访。结果显示，64%的儿童至少使用过一次抗生素，约58%的儿童使用了抗厌氧菌类抗生素，包括青霉素、阿莫西林、四环素、甲硝唑、头孢西丁等。

随访期间，近750名儿童罹患克罗恩病或溃疡性结肠炎，常见症状包括腹痛、腹泻和体重下降。与未接受抗生素治疗的婴儿相比，1岁前使用抗生素的儿童患病风险高出5倍以上，但随着年龄增长，这种相关性减弱。尽管服用抗生素使肠道疾病风险增加84%，但在实际人群中绝对风险并不高。

在美国，每年约49万名儿童使用抗生素处方，其中约一半为青霉素。作者估计，这些处方每年可能导致1700例IBD。已知抗生素会改变肠道菌群的自然环境，Kronman推测抗生素可能通过诱发炎症而导致肠道疾病。他怀疑抗厌氧菌类抗生素是驱动风险升高的主要原因，因为肠道内绝大多数细菌是厌氧菌，但研究未发现四环素与肠道疾病相关。

另一主要研究人员Muinos认为，抗生素破坏了厌氧菌的聚集地，从而增加肠道疾病风险。Kronman强调，该研究并非要求儿童不惜代价避免使用抗生素，而是应明智地使用抗生素。