2 人类表观基因组计划（HEP）

目前未见一些类似人类蛋白质组计划那样规模的表观基因组计划，不过欧洲人类表观基因组协会（Human Epigenome Consortium，HEC；http://www.epigenome.org/）已于2003年10月宣布开始投资和实施一项称为“人类表观基因组计划（Human Epigenome Project，HEP）”的计划。该计划的目标是利用5年时间绘制人类基因组甲基化可变位点（methylation variable positions，MVP）图谱，以在表观基因组水平上对DNA甲基化进行精确定量分析的表观遗传学标记（epigenetic markers）。由表观基因组学（涉及基因组学与表观遗传学）的研究内容来看，除了DNA甲基化的研究，还有很多内容，仅表观遗传学就还包括组蛋白修饰（如乙酰化）、染色质重塑、非编码小RNA等的研究。可见由欧洲国家英、法、德三国参与实施的“人类表观基因组计划”还不足以成为表观基因组方面的代表计划。正因为此，美国癌症研究协会也曾提出人类表观遗传学组计划（Human Epig enome Project）的类似的提法。

不过，2010年1月，国际人类表观遗传学合作组织（International Human Epigenome Consortium，IHEC；http://ihec-epigenomes.net/）由来自加拿大、意大利、日本、韩国、美国、法国、英国、澳大利亚等国家的顶级生物学家参加的国际人类表观遗传学合作组织在巴黎成立。这个全球协会将在第一阶段的10年内标记出1 000个参考表观基因组（reference epigenome）。IHEC第一阶段筹得资金1亿3千万美元。该协会参与者必须无偿交流各自的实验数据。美国国立卫生研究院（NIH）因发起这项研究，表示将投入1亿9千万美元。目前，IHEC实施的表观基因组相关计划有2个：“表观基因组平台计划（Epigenomic Platform Program）”和“疾病表观基因组（Disease Epigenome）”。

其中“表观基因组平台计划”由加拿大表观遗传学、环境和健康研究联盟（CEEHRC）实施管理。该机构将协调加拿大现有的基因组测序设备充分发展关注人类健康和疾病的表观遗传方面的研究能力。该机构将资助4个中心：2个表观基因组图谱中心（Epigenomic Mapping Centres，EMCs）和2个表观基因组数据合作中心（EDCCs），5年总投资达1 500万美元。

“疾病表观基因组”计划其实是日本科技部（Japan Science and Technology Agency，JST）推出的“科学技术发展推进核心项目（Core Research for Evolutional Science and Technology，CREST）”中的领头计划（leading program）。这也是因为2011年，日本科技部已发起过一项称为“开发依赖表观基因组分析进行诊断和治疗的基本技术”的项目与“疾病表观基因组”研究主题相契合。从2011年至2013年每年发布一次招标方案，中标者将获得五年资助，该计划将持续8年，总投资为5 000万美元。

虽然这两个表观基因组计划也不能成为人类表观基因组方面的代表性计划，但国际人类表观遗传学合作组织的成立为未来推出类似人类蛋白质组计划类似重量级的计划带来了可能。

3 人类代谢组计划

代谢组学（metabonomics/metabolomics）是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想，对生物体内所有代谢物进行定量分析，并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式。相比基因组学研究，研究人员认为代谢组学研究对医药研究和临床实践更能产生直接的影响。目前，大多数医疗检查都是基于血液或者尿液中的代谢物的水平，然而只有不到1%的代谢物得到经常性的检查，限制点在于人类代谢组学研究还很欠缺所致。

鉴于此，2005年加拿大基因委员会（Genome Canada）投资750万美元创建了“人类代谢组计划”（Human Metabolome Project，HMP），旨在通过促进代谢组学研究改善疾病诊鉴别、预防和监测方式，提高对药物代谢和毒理学的认识，在人类基因组和人类代谢组中架起联结桥梁，并开发代谢组学研究工具。该计划将对人体组织中可能发现代谢物及浓度大于1微摩尔的体液进行定性、定量分析并对其进行分类和存储。相关信息存储在人类代谢组数据库（Human Metabolome Database；www.hmdb.ca）中，而相关化合物将存储在人类代谢组图书馆中（Human Metabolome Library；www.metabolibrary.ca）。另外，还将开发定量研究代谢组学的新方法、技术和工具，并构建代谢组学样本库。

2007年，研究人员宣布完成了人类代谢组物的首个草图，编制并描绘了人体内的2 500种代谢物，1 200种药物，以及3 500种食品的成份。

参与该计划的机构或人员主要来自加拿大，由来自加拿大阿尔伯特大学（University of Alberta）和卡尔加里大学（University of Calgary）的50多名研究人员组成。

从研究队伍的国际性，投资经费上来看，其规模与人类基因组计划并不是同一个等级上的计划，但并不意味着否定该计划的重要性，或者现阶段加强代谢组学的研究，比人类基因组计划对临床医学领域实践能产生更为重大的影响。

（未完待续）

游文娟 整理