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昆明动物所开发新型计算模型预测抗癌药物活性

2012-12-17 03:43 昆明动物研究所 Bioinformatics 阅读 0
核心摘要: 中国科学院昆明动物研究所开发了一种基于分子药效团的小分子比对算法,用于预测抗癌药物活性。该算法通过交叉验证达到0.878的AUC值,显示出良好的预测能力。研究团队还建立了在线服务器CDRUG,方便研究者使用。成果发表于Bioinformatics期刊。

癌症是全球人口死亡的首要原因,每年导致超过720万人死亡。在中国,每年因癌症死亡的人数也超过170万。因此,开发新型抗癌药物是科学界和医学界的热点与难点。然而,传统实验方法筛选抗癌药物成本高、周期长。目前已知的小分子化合物超过1000万个,直接通过实验筛选几乎不可能。因此,建立高效、可靠、准确的计算生物学筛选系统对于发现新抗癌药物具有重要意义。

中国科学院昆明动物研究所生物信息与系统生物学实验室黄京飞研究员指导李功华博士,开发了一种基于分子药效团的小分子比对算法,并将其应用于预测小分子的抗癌活性。通过交叉验证,该算法的预测线下面积(AUC)达到0.878,表明其能有效预测药物小分子的抗癌活性。为方便不同学科的研究者和医药工作者使用,李功华开发了简便易用的网页服务器(http://bsb.kiz.ac.cn/CDRUG/)。

该研究成果发表于计算生物学权威期刊《Bioinformatics》上。

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