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5篇Blood论文提出全面的血细胞“路线图”

时间:2014-04-01 09:27来源:生物通   作者:未知

2014年3月26日,发表在《Blood》上的5篇论文,对人体中5种独特的血细胞,进行了前所未有的深入研究,确定了关键调节基因在这些血细胞中的位置,并为科学家们确定血细胞如何形成以及阐明血液病的病因,提供了一种新工具。

发表最新一期《Blood》上的这项研究工作,是一项大型多国协作计划FANTOM的一个子集。FANTOM 计划全称为“哺乳动物基因组功能注释”(Functional Annotation of the Mamaliam Genome),是日本理化研究所(RIKEN)于2000年启动的项目,其目标利用最先进的cDNA技术,建立完整的人类基因文库。此次的FANTOM 5计划(FANTOM计划的第五阶段)共有来自全球20个国家和地区、分属于114个科研机构的超过250名生物细胞学和生物信息学领域的专家参与。相关研究论文(总共18篇)分别发表在《Nature》杂志(2篇)和其它10本学术期刊(16篇)上。其中,在线发表于今天的《Nature》杂志的两篇论文,描述了来自广泛基因组图谱项目的重要观察结果,相关新闻见:Nature等18篇文章改变我们对基因组的理解;另外一项研究结果也发表在今天的《BMC Genomics》。

血细胞主要包括三种类型:红细胞(红血细胞)、白血球(白血细胞)和血小板,它们都起源于造血干细胞。虽然这些细胞的起源是已知的,但是,发生在干细胞中决定其是变成红细胞、白细胞还是血小板——或者甚至产生遗传突变——的基因表达变化,尚未完全了解。

为了探究这一过程,研究人员分析了超过30个不同的特定亚型白血细胞(包括肥大细胞、T细胞、单核细胞、粒细胞和B细胞),并对称为增强子和启动子的关键区域进行了定位,这些区域决定着一个特定基因在细胞内是被激活还是被沉默。通过识别和定位这些调控基因,研究人员能够将它们与特定基因的活性相关联。

FANTOM5的首席研究员、日本理化研究所的Alistair Forrest博士指出:“在此之前,研究人员只能够识别增强子和启动子的特定标签;然而,它们的确切位置以及与特定血细胞的特定增强子之间的联系,仍不清楚。这一新的公开可用资源的变化,为血液学家提供了大多数血细胞类型的一个基准参考,使他们能够跟踪这些细胞的发展,并确定在此过程中可能发生了什么而引导它们到达最终状态。”

在对每个血细胞内增强子和启动子位置有了新的了解之后,现在研究人员可以更好地设计实验来确定基因如何被激活,这有可能带来一种新策略的开发,即关闭这个基因来预防或治疗恶性肿瘤。

Forrest博士称:“引起正常细胞转变为癌细胞的特定遗传改变,出现在细胞的信使RNA水平上,这些差异往往是非常微妙的。因为我们对这些细胞类型有非常详细的描述,现在我们可以回过头来,将癌细胞与它们的起源细胞进行比较,以更好地了解是什么引起细胞发生故障,因此,我们将能够更有针对性地开发更有效的新疗法。”(生物通:王英)

(责任编辑:泉水)
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