18.1mol/L MgCl2溶液 【配制方法】 在800ml水中溶解203.4g MgCl2·6H2O,用水定容至1L,分装成小份并高压灭菌备用。 【注意】 MgCl2极易潮解,应选购小瓶(如100g)试剂,启用新瓶后勿长期存放。 19.β-巯基乙醇(BME)溶液 【配制方法】 一般得到的是14.4mol/L溶液,应装在棕色瓶中保存于4℃。 【注意】 BME或含有BME的溶液不能高压处理。 20.NBT溶液 【配制方法】 把0.5g氯化氮蓝四唑溶解于10ml 70%的二甲基甲酰胺中,保存于4℃。 21.酚/氯仿溶液 【配制方法】 把酚和氯仿等体积混合后用0.1mol/L Tris·HCl(pH7.6)抽提几次以平衡这一混合物,置棕色玻璃瓶中,上面覆盖等体积的0.01mol/l Tris·HCl(pH7.6)液层,保存于4℃。 【注意】 酚腐蚀性很强,并可引起严重灼伤,操作时应戴手套及防护镜,穿防护服。所有操作均应在化学通风橱中进行。与酚接触过的部位皮肤应用大量的水清洗,并用肥皂和水洗涤,忌用乙醇。 22.10mmol/L苯甲基磺酰氟(PMSF)溶液 【配制方法】 用异丙醇溶解PMSF成1.74mg/ml(10mmol/L),分装成小份贮存于-20℃。如有必要可配成浓度高达17.4mg/ml的贮存液(100mmol/L)。 【注意】 PMSF严重损害呼吸道粘膜、眼睛及皮肤,吸入、吞进或通过皮肤吸收后有致命危险。一旦眼睛或皮肤接触了PMSF,应立即用大量水冲洗之。凡被PMSF污染的衣物应予丢弃。 PMSF在水溶液中不稳定。应在使用前从贮存液中现用现加于裂解缓冲液中。PMSF在水溶液中的活性丧失速率随pH值的升高而加快,且25℃的失活速率高于4℃。pH值为8.0时,20μmmol/l PMSF水溶液的半寿期大约为85min,这表明将PMSF溶液调节 为碱性(pH>8.6)并在室温放置数小时后,可安全地予以丢弃。 23.磷酸盐缓冲溶液(PBS)溶液 【配制方法】 在800ml蒸馏水中溶解8g NaCl、0.2g KCl、1.44g Na2HPO4和0.24g KH2PO4,用HCl调节 溶液的pH值至7.4加水定容至1L,在15lbf/in2(1034×105Pa)高压下蒸气灭菌20min。保存于室温。 24.1mol/L乙酸钾(pH7.5)溶液 【配制方法】 将9.82g乙酸钾溶解于90ml纯水中,用2mol/L乙酸调节 pH值至7.5后加入纯水定容到1L,保存于-20℃。 25.乙酸钾溶液(用于碱裂解) 【配制方法】 在60ml 5mol/L乙酸钾溶液中加入11.5ml冰乙酸和28.5ml水,即成钾浓度为3mol/L而乙酸根浓度为5mol/L的溶液。 26.3mol/L乙酸钠(pH5.2和pH7.0)溶液 【配制方法】 在80ml水中溶解408.1g三水乙酸钠,用冰乙酸调节 pH值至5.2或用稀乙酸调节 pH值至7.0,加水定容到1L,分装后高压灭菌。 27.5mol/L NaCl溶液 【配制方法】 在800ml水中溶解292.2g NaCl加水定容至1L,分装后高压灭菌。 28.10%十二烷基硫酸钠(SDS)溶液 【配制方法】 在900ml水中溶解100g电泳级SDS,加热至68℃助溶,加入几滴浓盐酸调节 溶液的pH值至7.2,加水定容至1L,分装备用。 【注意】 SDS的微细晶粒易扩散,因此称量时要戴面罩,称量完毕后要清除残留在称量工作区和天平上的SDS,10%SDS溶液无须灭菌。 29.20×SSC溶液 【配制方法】 在800ml水中溶解175.3g NaCl和88.2g柠檬酸钠,加入数滴10mol/l NaOH溶液调节 pH值至7.0,加水定容至1L,分装后高压灭菌。 30.20×SSPE溶液 【配制方法】 在800ml水中溶解17.5g NaCl、27.6g NaH2PO4·H2O和7.4g EDTA,用NaOH溶液调节 pH值至7.4(约需6.5ml 10ml/L NaOH),加水定容至1L,分装后高压灭菌。 31.100%三氯乙酸溶液 【配制方法】 在装有500g TCA的瓶中加入227ml水,形成的溶液含有100%(M/V)TCA。 32.1mol/L Tris溶液 【配制方法】 在800ml水中溶解121.91g Tris碱,加入浓HCl调节 pH值至所需值。 pH HCl 7.4 70ml 7.6 60ml 8.0 42ml 应使溶液冷至室温后方可最后调定pH值,加水定容至1L,分装后高压灭菌。 【注意】 如1mol/L溶液呈现黄色,应予丢弃并置备质量更好的Tris。 尽管多种类型的电极均不能准确测量Tris溶液的pH值,但仍可向大多数厂商购得合适的电极。 Tris溶液的pH值因温度而异,温度每升高1℃,pH值大约降低0.03个单位。例如:0.05mol/L的溶液在5℃、25℃、和37℃时的pH值分别为9.5、8.9和8.6。 33.Tris缓冲盐溶液(TBS)(25mmol/l Tris) 【配制方法】 在800ml蒸馏水中溶解8g NaCl、0.2g KCl和3g Tris碱,加入0.015g酚并用HCl调至pH值至7.4,用蒸馏水定容至1L,分装后在151bf/in2(1.034×105Pa)高压下蒸汽灭菌20min,于室温保存。 34.X-gal溶液 【配制方法】 X-gal为5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D半乳糖苷。用二基甲酰胺溶解X-gal配制成的20mg/ml的贮存液。保存于一玻璃管或聚丙烯管中,装有X-gal溶液的试管须用铝箔封裹以防因受光照而被破坏,并应贮存于-20℃。X-gal溶液无须过滤除菌。 杂交试验中用于降低背景的封闭剂 试剂 用途 Denhardt试剂 Northern杂交 使用RNA探针的杂交 单拷贝序列的Southern杂交 将DNA固定于尼龙膜上的杂交 Denhardt试剂通常配制50×贮存液,过滤后保存于-20℃。可将该贮存液10倍稀释于预杂交液(常为含有0.5%SDS和100μg/ml经变性被打断的鲑精DNA的6×SSC或6×SSPE)中。50×Denhardt液中含5g聚蔗糖(Ficoll,400型,Pharmacia)、5g聚乙烯吡咯烷酮和5g牛血清白蛋白(组分V”Sigmal),加水至终体积为500ml。 BLOTTO Grunstein-Hogness杂交 Benton-Davis杂交 除单拷贝序列Southern杂交以外的所有Southern杂交 斑点印迹 1×BLOTT(牛乳转移技术优化液,Bovine Lacto Transfer Technique Optimizer),是含5%胶脂奶粉和0.02%叠氮钠的水溶液,应保存于4℃。使用前可用预杂交液稀释25倍。BLOTTO不应与高浓度的SDS并用,因为后者会导致牛奶中蛋白质析出。如果杂交背景不合要求,可在杂交液中加入NP-40至终浓度为1%。BLOTTO不能用作Northern杂交的封闭剂,因为这一封闭剂中可能含有RNA酶,其活性之高使人无法接受。 注意:叠氮钠有毒性,取用时需戴手套小心操作。含叠氮钠的溶液应予明确标记。 肝素 Southern杂交 原位杂交 肝素(Sigma H-7005,从猪中提取的二级产品或相当等级的产品)用4×SSPE或4×SSC溶解配制成50mg/ml的浓度,保存于4℃。肝素在含有葡聚糖硫酸酯的杂交液中用作封闭剂的浓度为500μg/ml,在不含葡聚糖硫酸酯的杂交液中的浓度为50μg/ml。 经变性并被打断的鲑精DNA southern和Northern杂交 把鲑鱼精子DNA(Sigma,Ⅲ,盐钠)溶解于水配制成10mg/ml的浓度,必要时于室温磁力搅拌2~4h助溶。把溶液中NaCl的浓度调至0.1mol/L,并用酚和酚/氯仿各抽提一次,回收水相。合DNA溶液快速通17号皮下注射针头12次,以剪切DNA。加入2倍体积用冰预冷的乙醇沉淀DNA。离心回收DNA并重溶于水,配制成10mg/ml的浓度,测定溶液的OD260值并计算出精确的DNA浓度,然后煮沸10min,分装成小份保存于-20℃。使用前置沸水浴中加热5min,然后迅速在冰浴中骤冷。预杂交液中应含有100μg/ml经变性并被打断的鲑鱼精子DNA 六、常用凝胶的技术参数 1.葡聚糖凝胶的某些技术数据 种类 干颗粒直径(μ) 分子量分级范围 床体积毫升/克干分子筛 得水值 溶胀最少平衡时间(h) 柱头压力(kPa)(2.5cm直径柱) 肽及球形蛋白质 葡聚糖(线性分子) 室温 沸水浴 Sephadex G-10 40~ 120 ~700 ~700 2~ 3 1.0±0.1 3 1 Sephadex G-10 40~ 120 ~1500 1500 2.5~3.5 1.5±3.5 3 1 Sephadex G-25 粗级 100~300 (≈5~100目) 中级 50~150 (≈100~200目)
1,000~ 细级 20~800(≈200~400目) 超细 10~40 Sephadex G-50 粗级 100~200 中级 50~150 1,500~ 500~ 细级 20~80 30,000 10,000 9~11 5.0±0.3 6 2 超细 10~40 Sephadex G-75 40~120 3,000~ 1,000~ 超细 10~40 70,000 950,000 12~15 7.5±0.5 24 3 3.92~15.86 Sephadex G-100 40~120 4,000~ 1,000~ 超细 10~40 1,500,000 150,000 15~20 10.0±1.0 48 5 2.35~9.41 Sephadex G-150 40~120 5,000~ 1,000~ 20~30 超细 10~40 400,000 150,000 18~22 15.0±1.5 72 5 0.88~3.53 Sephadex G-200 40~120 5000~ 1000~ 30~40 10~40 800,000 200,000 20~25 20.0±2.0 72 5 0.39~1.57 2.聚丙烯酰胺凝胶的技术数据 型号 排阻的下限 (分子量) 分级分离范围 (分子量) 膨胀后的床体积(ml/g干凝胶) 膨胀所需最少时间(室温,h) Bio-gel-P-2 1,600 200~2,000 3.8 2~4 Bio-gel-P-4 3,600 500~4,000 5.8 2~4 Bio-gel-P-6 4,600 1,000~5,000 8.8 2~4 Bio-gel-P-10 10,000 5,000~17,000 12.4 2~4 Bio-gel-P-30 30,000 20,000~50,000 14.9 10~12 Bio-gel-P-60 60,000 30,000~70,000 19.0 10~12 Bio-gel-P-100 100,000 40,000~100,000 19.0 24 Bio-gel-P-150 150,000 50,000~150,000 24.0 24 Bio-gel-P-200 200,000 80,000~200,000 34.0 48 Bio-gel-P-300 300,000 100~400,000 40.0 48 3.琼脂糖凝胶的技术数据 型号 琼脂糖含量 %(W/W) 排阻的下限 (分子量) 分级分离的范围(分子量) 生产厂家
Sepharose 4B
4
0.3×106~3×106
Pharmacia
Sepharose 2B
2
2×106~25×106
Sagavac 10
10
2.5×105
1×104~2.5×105
4.各处凝胶所允许的最大操作压 凝胶 最大静水压(kPa) Sephadex G-10 9.8 G-15 9.8 G-25 9.8 G-50 9.8 G-75 4.9 5.琼脂糖凝胶浓度与线性DNA分辨范围 凝胶浓度(%) 线性DNA长度(bp) 0.5 1000~30000 0.7 800~12000 1.0 500~10000 1.2 400~7000 1.5 200~3000 2.0 50~2000 6.染料在变性聚丙烯酰胺凝胶中的迁移速度 凝胶浓度(%) 溴酚蓝 二甲苯青FF 5.0 35bp 140bp 6.0 26bp 106bp 8.0 19bp 75bp 10.0 12bp 55bp 20.0 8bp 28bp 7.染料在非变性聚丙烯酰胺凝胶中的迁移速度 凝胶浓度(%) 溴酚蓝 二甲苯青FF 3.5 100bp 460bp 5.0 65bp 260bp 8.0 45bp 160bp 12.0 20bp 70bp 15.0 15bp 50bp 20.0 12bp 45bp 七、氨基酸的特性 氨基酸名称 三字母缩写 单字母缩写质量 侧链电离的pHa值 结构式 丙氨酸(alanine) Ala A 89.09 精氨酸(arginine) Arg R 174.2 12.48 (责任编辑:泉水) |