人类流感病毒株染色体基因序列已公布

　　流行性感冒每年造成36,000以上的美国人死亡，因此进一步了解这种疾病是相当有必要的。

　　研究人员公布超过200种人类流行性感冒病毒株的基因序列。这项信息将共享于数据库中，可帮助科学家更了解流感病毒的演化、传播和致疾机制。

　　新发表的基因组资料让科学家确定，为什么目前的流行性感冒疫苗无法充分地保护接种的个体免于感染。

　　研究报告将发表于10月5日Nature的网络版。这项新数据可以给与科学家最完整的图信息，了解流行性感冒病毒的演化和在人类之间的传递。同时也能帮助制药公司研发出更有效的疫苗、治疗方法和诊断方式。

　　这项研究完整地将209株流感病毒定序，确定了超过2百8十万个核苷酸碱基。

　　在2005—2006年流感流行季节前夕,美国基因组研究所(TIGR)的科学家找到了流感病毒基因组在不断进化的证据。他们将这一首次大规模流感病毒测序的研究结果10月5日在线发表在Nature杂志上。

该研究证明在人群中流行的流感病毒在迅速进化,研究者还提出了监测流感病毒的新策略。

　　流感病毒长期存在于人类社会,即使在普遍接种流感疫苗的人群,甲型流感病毒也十分猖獗,并且是导致人类患病和死亡的重要原因。流感病毒每年变异,导致疫苗失效,需不断选择新的病毒株来制备疫苗。如果病毒发生抗原性转变(antigenic  shift),则人群对新病毒株缺乏免疫力,即导致全球大流行。发生在20世纪的3次流感大流行(1918年、1957年和1968年)死亡人数就达数千万。

　　虽然1933年人类就分离出了第一株流感病毒,但对流感病毒是如何进化的还是不完全清楚。为更好地了解流感病毒的进化,在过去5个流感季节(1999—2004年),TIGR的科学家测定了209株流感病毒的全部基因组序列(包括2821103个核苷酸),并对其基因组进行比较。这些甲型流感病毒株是从美国纽约州流感病人中分离获得的,其中207株为H3N2,2株为H1N2。

　　该研究显示,在5年研究期间,纽约州至少有3种H3N2亚群,在一些流感流行季节,这3种变异病毒同时存在,即人群患病类似,但感染的病毒不同。TIGR病毒基因组学实验室主任Ghedin说,即使在这一相对较小的地理区域内,流感病毒的变化也呈现显著的多样性,变异病毒发生了遗传物质交换。

　　该研究证明,这些变异株是流感病毒可以利用的遗传资源库,一小群流感病毒株在局部传播,并向不同方向进化,如一株与另一株混合即出现新的优势病毒株。该研究报告的全部序列已输入公共数据库(例如GenBank),科学家可以随时查阅。

　　在每个流感季节,全球的科学家都试图确定流行的优势流感病毒株,并将优势株列入下一个流感季节的疫苗研制之中。但因为流感病毒在不断进化,预测工作非常困难。目前,基因组学成为研究流感病毒进化的新热点。通过破译不同流感病毒株的基因组密码,科学家可以准确确定发生变异的部位,这些变异使病毒的毒性增加,使其能够感染新的物种或逃避免疫应答。研究人员指出,基因组研究可帮助人们更好地跟踪流感病毒,开发更有效的疫苗。

        9月22日出版的Nature杂志以“Flu  researchers  slam  US  agency  for  hoarding  data”为题，说明了近期美国疾病控制中心（CDC）封锁了他们的研究，其它流感专家已经很难从CDC获得研究数据这一另人费解的情况。

        之前布什总统还在关于新奥尔良飓风影响的发言中呼吁建立一个各国联合对抗禽流感（分享WHO世卫组织的禽流感信息和样品）的国际联盟，但是通过Nature的调查，发现位于美国亚特兰大的CDC中心流感组没有把他们已知的禽流感病毒序列以及免疫学流行病学相关数据公布，因此阻延了禽流感研究。虽然现行的政策规定，在每一次流感来袭之前所生产的疫苗的全部数据是不会公开的，但来自美国休斯顿的Rice大学物理学家Michael  Deem认为这一政策是不合理的，应该废止，他这一看法获得了许多科学家的赞同。一位进化生态学家表示，CDC所做的工作十分重要，但是要从他们那儿获得数据资料真是相当的困难的一件事。研究人员目前并不确定CDC到底有多少流感病毒序列相关数据，但是一位来自NIH的生物信息学家说除了那些通过杂志发表的之外，CDC的数据“coming  through  an  eye  dropper”（说明数据公布之慢，生物通注）。Nature的分析家同意这一看法——就连在Genebank的和在新墨西哥Los  Alamos国家实验室的大约15,000个流感序列都还没有到CDC数据的十分之一。

        CDC病毒与立克次体疾病（viral  and  rickettsial  diseases）研究组主任James  LeDuc也承认分享数据是十分的重要，但是表示CDC不能满足所有索要信息的要求。然而研究人员认为CDC应该更加努力的满足科研的要求，因为作为一种最近侵袭了亚洲、俄罗斯和哈萨克斯坦（Kazakhstan）的疾病，禽流感如果没有更有效的疫苗被研制出来，可能会成为新一轮的流感灾难。 (责任编辑：泉水)

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