异染色质(heterochromatin)对于着丝粒(centromere)和端粒(telomere)正确行使功能必不可少,而且对于一些特殊位点上的基因沉默也具有重要贡献。最近在有关裂殖酵母(fission yeast)中异染色质形成的模型中,学者认为蛋白质Rik1招募组蛋白甲基转移酶Clr4到染色体的特定位点,接着Clr4促使组蛋白-3(histone-3;H3)上K9甲基化,这一修饰招募来了更多其他蛋白质,导致异染色质形成并将之作为核心不断扩散开来。
在杂志Genes & Development中,Peterson和同事发现了新的Rik1相关蛋白,对异染色质的形成提出了新的见解。使用串联亲和纯化(tandem affinity purification,TAP)和质谱(mass spectrometry)等技术,作者向我们展示了一些和Rik1具有相关性的蛋白:Clr4,组蛋白H2B,两种新蛋白(他们将之命名为Rik1相关因子1和2(Rik1-associated factor-1;Raf1和Raf2)),Pcu4和Pip1(cullin依赖的泛素连接酶系统的组成部分)。 因为Pcu4、Pip1和Rik1同时被纯化出来,表明Rik1可能与泛素化(Ubiquitylation;见备注)过程相关。作者指出,在有重组的泛素激活酶和泛素结合酶存在的前提下,Rik1复合物可以在体外促使候选基质H2B聚泛素化(polyubiquitylate)。他们还指出,Raf2和Clr4是泛素连接酶复合物的重要组成部分。 随后,Peterson和同事们研究了Rik1相关蛋白在异染色质相关功能中的地位。首先,他们研究了新蛋白Raf1和Raf2在转入基因转录后沉默中的作用;转基因所处的位置是在着丝粒异染色质区域。实验表明,rik1, clr4, raf1或raf2等基因的敲除会解除转入基因的抑制作用;但是敲除并不会影响插入到常染色质区域的基因的表达状况。所以这些蛋白特异性地作用于异染色质区域。 Rik1和Clr4对于H3甲基化的着丝粒模式是必需的,即造成H3-K9甲基化丰富,H3-K4甲基化减少。那么,Raf1和Raf2是否影响这个甲基化模式?敲除raf1或raf2和敲除rik1或clr4有着相同的效应:导致H3-K9甲基化减少,H3-K4甲基化增多。结合转基因沉默的结果,这些现象表明,在影响异染色质中H3甲基化调控的基因沉默机器中,Raf1和Raf2是新发现的组成部分。 Peterson和同事继续研究了Rik1复合物的泛素连接酶活性在异染色质形成中的地位。使用Pcu4的一个显性失活等位基因(dominant-negative allele),他们发现Pcu4对于异染色质沉默具有重要贡献。特别地,Pcu4依赖的泛素连接酶在异染色质结构域形成中通过防止错误的H3-K4甲基化实现其功能。 从而,作者们发现了在着丝粒异染色质的转录沉默中必需的两种新蛋白,Raf1和Raf2;同时还发现了对异染色质形成必需的Rik1相关的E3泛素连接酶。相信今后的研究会阐述清楚这些蛋白质的具体分子功能。 备注: 泛素化/Ubiquitylation:指泛素多肽链共价结合目标蛋白质的过程,牵涉的酶主要有以下三种,E1泛素激活酶/E1 ubiquitin-activating enzyme,E2泛素结合酶/E2 ubiquitin-conjugating enzyme,E3泛素蛋白连接酶/E3 ubiquitin-protein ligase。泛素化已经成为控制膜蛋白的表面表达的重要机制,也是一种广泛调控真核细胞功能的翻译后修饰的方法。 编者注:摘译自ORIGINAL RESEARCH PAPER Horn, P. J., Bastie, J. -N. & Peterson, C. L. A Rik1-associated, cullin-dependent E3 ubiquitin ligase is essential for heterochromatin formation. Genes Dev. 19, 1705−1714 (2005) FURTHER READING Maison, C. & Almouzni, G. HP1 and the dynamics of heterochromatin maintenance. Nature Rev. Mol. Cell Biol. 5, 296−305 (2004) (责任编辑:泉水) |