2005年2月4日  美国《科学》周刊307卷   第5710期   提要
参考SCIENCE CHINA 如有出入，以原文为准

深海中的生物群落

在距表面10,896米以下的海洋最深处，科学家发现了主要由脆弱的软壁单细胞物种构成的生物群落，其中大多数物种是首次发现。对Yuko Todo和同事来说出乎意料的是，他们发现这些被称为有孔虫(foraminifera)的生物群落生活在太平洋的马里亚纳海沟的挑战者深渊(Challenger Deep)。有孔虫是单细胞的原生生物，通常有硬壳，主要生活在海洋中。它们在深海环境中很少见，而且对地质学和生物学具有极为重要的意义。这些新发现的软壁有孔虫所属的谱系包括唯一的入侵了淡水和陆地的有空虫物种，这些新生物体的DNA的分析表明，它们代表一种寒武纪以前的生物原始形式，更复杂的多腔生物是从这些原始形式进化而来的。文章作者说，挑战者深渊的深度也许是在过去的600万到900万年前形成的，最近他们在那里发现的这些生物体，可能是那些能够适应随深度增加而不断增加的压力的种群的后代。
简报：Simple Foraminifera Flourish at the Ocean's Deepest Point, Yuko Todo, Hiroshi Kitazato, Jun Hashimoto, and Andrew J. Gooday

与克隆氏病有关的小鼠蛋白

两个研究小组分别在本期发表报告指出，缺少一个与人类克隆氏病(Crohn's Disease)关系密切的功能蛋白质的小鼠，更容易受肠道细菌感染。虽然人们还不知道究竟是什么原因导致这种疾病，但是这些发现为了解这种发炎性肠道紊乱症患者身上发生了什么提供了线索。克隆氏病通常在肠道下部引发炎症，导致疼痛和腹泻。帮助免疫系统识别肠道细菌的Nod2基因的突变，与这种疾病的已感性有关。Shin Maeda和同事观察到，与人类的克隆氏Nod2突变等价的小鼠Nod基因的突变，使小鼠更容易患一种实验型肠道发炎。他们的结果表明，Nod2蛋白质调节两个与发炎有关的关键信号分子：NF-kappa-B 和IL-1。
在另一篇文章中，Koichi S. Kobayashi和同事报告，Nod2蛋白质有问题的小鼠更易被口腔细菌感染，这种易感性与缺少Nod2细胞对与Nod2结合的分子的响应降低有关。在带有突变的小鼠身上，一组编码肠道的天生抗微生物肽的基因活性尤其地降低了，这表示一个类似的缺陷也许是人类发炎性肠道紊乱症的原因。
报告：Nod2 Mutation in Crohn's Disease Potentiates NF-{kappa}B Activity and IL-1{beta} Processing, Shin Maeda, et al.
报告：Nod2-Dependent Regulation of Innate and Adaptive Immunity in the Intestinal Tract, Koichi S. Kobayashi, et al.

卡普西肉瘤如何发生

一项新研究发现了一个病毒和宿主间的相互作用能解释卡普西肉瘤是如何发生的这个由来已久的谜，卡普西肉瘤是没有得到治疗的艾滋病人最常见的癌症。卡普西肉瘤发生在皮下组织以及口腔、鼻子和肛门的粘膜中。肿瘤表现为紫色、棕色、或红色的病灶。人们很早就知道卡普西肉瘤是一种名为KSHV 的疱疹病毒感染导致的，而且卡普西肉瘤肿瘤细胞制造也需要一种名为细胞因子的宿主蛋白。细胞因子是免疫系统的产物，它激发炎症，这也是卡普西肉瘤肿瘤的一个重要特征。研究人员显示，由KSHV产生的kaposin B蛋白质激活宿主细胞蛋白MK2，这是一个细胞生产细胞因子的主要调节因子之一。这项研究也许揭示了一个感染和细胞因子产生的新的和直接的联系，同时说明了这个不常见的特殊癌症如何能由病毒导致形成。
报告：The Kaposin B Protein of KSHV Activates the p38/MK2 Pathway and Stabilizes Cytokine mRNAs, Craig McCormick and Don Ganem

有关云形成的新信息

云是从“种子”生长的，种子使水蒸气凝聚形成云滴，新的实验室试验也许能帮助解决围绕着一类云种子如何在地球的大气层中形成的疑问。在一个与大气条件类似的实验室条件下，科学家用硫酸和水导致了硫酸粒子的形成，这种粒子是重要的“次级”云种子。和过去的尝试相比，硫酸粒子伊很快的速度形成，足以解释为什么它们在大气层中很丰富地自然存在。这些结果朝着更好地了解“云凝聚核”形成的机制迈出了重要的第一步。
报告：Rapid Formation of Sulfuric Acid Particles at Near-Atmospheric Conditions, Torsten Berndt, Olaf Boge, Frank Stratmann, Jost Heintzenberg, and Markku Kulmala

线粒体蛋白联系代谢与衰老

一项新研究说，一个与线粒体DNA有关的蛋白质有双重身份，它既是代谢调节因子，也是一个参与维护DNA的蛋白。这个名为顺乌头酸酶的蛋白“双功能性”的发现，为线粒体作为能量产生体的作用和线粒体DNA稳定性之间，以及线粒体疾病和衰老之间，提供了一个直接的联系。这些研究人员发现了与线粒体DNA有关的22个蛋白质，并研究了其中可能连接代谢和DNA维护的蛋白质。在真核生物的线粒体中，这些蛋白质与线粒体DNA集中在一起，形成一个被称为“拟核(nucleoid)”的遗传复合体。这些作者报告说，在特定的代谢条件下，需要顺乌头酸酶蛋白来维持线粒体DNA的稳定性，这个功能独立与该蛋白在克列伯氏循环(Krebs cycle)中的催化活动。这项工作提出，拟核也许以不同状态存在，要取决于它们所在细胞的代谢条件。
报告：Aconitase Couples Metabolic Regulation to Mitochondrial DNA Maintenance, Xin Jie Chen, Xiaowen Wang, Brett A. Kaufman, and Ronald A. Butow

需要全村参与-知情同意在马里

美国《科学》周刊为庆祝其创刊125周年，今年每月发表一篇“科学全球之声”短文。本期的作者是Ogobara Duombo，他写道，在马里以及其他发展中国家，为医学研究获得知情同意，需要用在欧洲和北美洲不常用的方法。Duombo介绍了他在马里为研究疟疾，如何用道德和文化敏感的方法获得知情同意的经验。扫盲率低、以及与集体决策相关的社会结构需要用西方不常用的方法，比如首先要向社区领头人介绍研究，而不是马上与可能的研究参与者讨论。一种赢得社区信任的方法是为社区提供医疗服务。但是，必须谨慎行事，以保证社区对医疗服务的可望，不成为社区参加不满足他们最佳利益研究的引诱。Duombo 说，“这一道德难题还没有解决，仍是一个大的忧虑”。
科学与社会短文：It Takes a Village: Medical Research and Ethics in Mali, Ogobara K. Doumbo