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寻找致病基因和群体遗传学研究的“金矿”(2)

时间:2006-01-25 12:23来源:科技日报 作者:bioguider 点击: 223次


  从购置安装设备、优化条件到产生数据,三年计划完成的项目,中国卷的起步就晚了近一年。二是资金严重不足,尤其是基因组所承担了中国卷的主要部分,项目经费平均至每个碱基,只相当于香港小组的一半出头,以这样的经费,要通过高通量、大规模的SNP分型反应追赶遥遥领先的其他团队,其难度和压力可想而知。  

  “用比别人低的成本去赶上我们落下的老长距离,除了拼命就没有法子了。”曾长青严肃地说。  



  “你知道我们一天能做多少反应?”  

  “最高记录是30万。两年多来,“中国卷”共上交通过质控检查的SNP分型数据是2500多万。”  

  “拼命是两种含义,一是所有人员牺牲节假日,机器24小时连轴转,二是使劲在每一个细节上把关,一分一厘的降低反应成本和运用科学理论,提高反应效率与成功率。我们是在最前沿领域使用高新技术进行实验反应和产生科学数据,单纯靠不睡觉也是完不成任务的。”曾长青如是说。  

  “最后你猜怎么着。”她饶有兴致地问道。我笑笑说:“巨大的成功是一定的。”  

  曾长青笑了:“我们完成了平台建设,用了半年多的时间,在2004年夏天就把进度赶上来了。到2005年初,中国团队是第一个完成所有补洞的。之所以能够在这么短的时间,用比别人少得多的经费,优质写完这本中国卷,还有一个必要条件,就是所有参加人员的相互支持和精诚合作。”  

  讲到这里,曾长青动情地说:“我们的员工和研究生们付出了极大心血,整个中国团队的各个小组、平台之间从始至终互相关照和帮助。就是与供应商和经贸人员的关系也大大超出了一般的商家—顾客关系。占整个计划10%%的HapMap中国卷的完成,有大量人员做出了无私贡献,我要向他们鞠躬致谢。”  



  ■专项备忘  

  国际HapMap计划于2002年10月28日正式宣布启动,共有来自全球6个国家数十个科研机构参加,研究数据及成果及时、免费对全球公布,是一项真正意义上的跨国界、跨学科的旨在造福全人类的全球合作科学研究计划。  

  HapMap计划中国卷的工作于2002年列入科技部“十五”国家重大科技攻关项目。同时香港特区政府对参与HapMap中国卷的三所香港大学也进行了资助。  

  至2004年夏天,开始赶上国际合作中的进度,至2004年底,完成了将近1600万份反应数据(15895968)。在2005年4个月内则完成SNP分型数据1800多万个(18470880)。  

  2005年10月26日,参加了HapMap的200余位科学家在美国盐湖城共同宣布:历时3年的人类基因组单体型图计划(HapMapProject)第一阶段工作圆满结束。中国团队作为发起者及合作者之一,为HapMap计划的顺利实施及成功完成做出了重要的贡献。  

  3年内,中国团队在国际统一的密度要求基础上,就自己负责的染色体区域向国际数据协调中心共递交并通过了国际数据质量控制体系检验的34713312个分型数据,圆满完成了HapMap计划中国卷的数据产生工作。   (责任编辑:泉水)
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