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美科学家首次用超级计算机模拟完整病毒

时间:2006-03-19 13:42来源:赛迪网 作者:bioguider 点击: 134次
3月19日消息,全球功能最强大的超级计算机之一制作了一个活着的病毒模型。研究人员称,这是首次以复杂的分子级的详细程度对整个病毒的生物组织进行计算机模拟。  

据theinquirer.net网站报道,这个模拟使当前的计算机的运算能力达到了极限。研究人员表示,通过模拟这个病毒,研究人员希望能够揭开病毒入侵细胞和引起疾病的秘密。  

美国伊利诺斯州立大学的Klaus  Schulten和他的同事们根据卫星烟草花叶病毒制作了一个计算机模型。这些研究人员是在位于Urbana的美国国家超级计算机应用中心使用一个名为“NAMD”的计算机程序模拟这个生物分子的。这些研究人员并行运行了数百了不同的处理器来解决这个计算机模拟问题。  

这个计算机程序计算了一个病毒中数百万个原子中的一个原子和周围的一滴盐水与其它百万分之一的原子之间在十亿分之一秒的时间内是如何互动的。这些研究人员还能够看到一个整个的病毒在500亿分之一秒的时间里活动状况。显然,这个病毒不对称的进进出出,好像是呼吸一样。研究人员称,这种计算机模拟要是使用台式电脑需要大约35年的时间。  

这个计算机模型还显示,当病毒进行自我复制的时候,病毒是围绕基因物质构建外壳,而不是向完整的外壳内部注入基因物质。人们以前曾以为脱掉外壳进行自我复制可能是病毒传播的第一步。研究人员称,我们看到了真正革命性的东西。  

计算机科学家以前也模拟过病毒,但是,仅限于模拟病毒的某一部分,在从这一部分推测整个病毒的情况。像这样模拟一个完整的病毒还是第一次。 (责任编辑:泉水)
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